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import pandas as pd
from sklearn import svm
from sklearn.model_selection import GridSearchCV, train_test_split
from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier, RandomForestClassifier
import chardet
from sklearn.metrics import accuracy_score, classification_report, confusion_matrix
from sklearn.preprocessing import RobustScaler
from datetime import datetime
from sklearn.model_selection import cross_val_score, KFold
from collections import Counter
from sklearn.metrics import precision_recall_curve, auc
from tensorflow.python.keras.models import Sequential
from tensorflow.python.keras.layers import Dense, Dropout
from scikeras.wrappers import KerasClassifier
from tensorflow.python.keras.optimizers import rmsprop_v2
from functools import partial
class ClasificadorDepresion:
def __init__(self, archivo, codificacion:str = 'utf-8', tecnica_datos=0, reporte="reporte.txt"):
self.archivo = archivo
self.ok = True
self.codificacion = codificacion
self.tecnica_datos = tecnica_datos
self.reporte = reporte
try:
self.df, self.X_train, self.X_test, self.y_train, self.y_test = self.crearConjuntos()
except:
self.ok = False
self.resultado_dict = {}
self.modelos = {}
def crearConjuntos(self):
file = open(self.reporte, "a")
file.write("###############################################################################\n")
file.write("## Conjunto: {} ##\n".format(self.archivo))
df = pd.read_csv(self.archivo, encoding=self.codificacion)
# Seleccionar las características y etiquetas
X = df.drop(["Class"], axis=1)
y = df["Class"]
file.write("Muestras {}\n".format(Counter(y)))
try:
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2, stratify=y, random_state=42)
# Normalizar los datos
scaler = RobustScaler()
X_train = scaler.fit_transform(X_train)
X_test = scaler.transform(X_test)
file.write("###############################################################################\n")
file.close()
return df, X_train, X_test, y_train, y_test
except Exception as e:
raise ValueError("no se pudo crear el dataset") from e
def clasificadorArboles(self):
model = RandomForestClassifier()
#'max_depth': None,
# 'min_samples_leaf': 4,
# 'min_samples_split': 10,
# 'n_estimators': 10,
# 'random_state' : 11
parametros = {
'n_estimators': [200], # Número de árboles en el bosque
'max_depth': [None], # Profundidad máxima de los árboles
'min_samples_split': [2], # Número mínimo de muestras requeridas para dividir un nodo interno
'min_samples_leaf': [1], # Número mínimo de muestras requeridas para estar en un nodo hoja
'random_state': [11] # Semilla para la reproducibilidad
}
# Configurar GridSearchCV
grid = GridSearchCV(model, parametros, scoring='accuracy', cv=3)
grid_resultado = grid.fit(self.X_train, self.y_train)
# Obtener el modelo con los mejores hiperparámetros
mejor_modelo = grid_resultado.best_estimator_
feature_importance = mejor_modelo.feature_importances_
# Realiza predicciones en un conjunto de prueba
y_pred = mejor_modelo.predict(self.X_test)
# Calcula la precisión del modelo en el conjunto de prueba.
accuracy = accuracy_score(self.y_test, y_pred)
# Calcula la curva precisión-recuperación y su área (PR-AUC)
precision, recall, _ = precision_recall_curve(self.y_test, y_pred)
pr_auc = auc(recall, precision)
# Imprime un informe detallado con otras métricas.
report = classification_report(self.y_test, y_pred, zero_division=1)
# Muestra la matriz de confusión.
confusion = confusion_matrix(self.y_test, y_pred)
self.imprimirReporte(
"Mejores hiperparámetros:\n{}\n".format(grid_resultado.best_params_),
"Importancia de las caracteristicas:\n {}\n".format(str(feature_importance)),
"PR-AUC: {}\n".format(pr_auc),
accuracy,
report,
confusion,
mejor_modelo,
"RF en {}".format(self.archivo))
return mejor_modelo
def clasificadorSVM(self):
# Especificar los pesos de clase
todo = len(self.df)
class_weights = {
0 : (self.df['Class'].value_counts()[0]) / todo,
1 : (self.df['Class'].value_counts()[1]) / todo,
}
parameters = {
'C': [0.1],
'degree': [4],
'gamma': [0.1],
'coef0': [1]
}
classifier = svm.SVC(kernel='poly', class_weight=class_weights)
# Perform grid search to find the best hyperparameters
grid_search = GridSearchCV(estimator=classifier, param_grid=parameters, scoring='accuracy', cv=5)
grid_search.fit(self.X_train, self.y_train)
best_model = grid_search.best_estimator_
y_pred = best_model.predict(self.X_test)
accuracy = best_model.score(self.X_test, self.y_test)
# Calcula la curva precisión-recuperación y su área (PR-AUC)
precision, recall, _ = precision_recall_curve(self.y_test, y_pred)
pr_auc = auc(recall, precision)
# Generate the classification report
report = classification_report(self.y_test, y_pred, zero_division=1)
# Generate the confusion matrix
confusion = confusion_matrix(self.y_test, y_pred)
self.imprimirReporte(
"Mejores hiperparámetros:\n{}\n".format(grid_search.best_params_),
"",
"PR-AUC: {}\n".format(pr_auc),
accuracy,
report,
confusion,
best_model,
"SVM en {}".format(self.archivo))
def clasificadorGradientBoosting(self):
# Definir parámetros para búsqueda en cuadrícula
parameters = {
'learning_rate': [0.1],
'n_estimators': [200],
'max_depth': [3],
'min_samples_split': [3]
}
# Inicializar el clasificador GradientBoostingClassifier
classifier = GradientBoostingClassifier(random_state=42)
# Realizar búsqueda en cuadrícula para encontrar los mejores hiperparámetros
grid_search = GridSearchCV(estimator=classifier, param_grid=parameters, scoring='accuracy', cv=5)
grid_search.fit(self.X_train, self.y_train)
# Evaluar el modelo con los mejores hiperparámetros en el conjunto de prueba
best_model = grid_search.best_estimator_
y_pred = best_model.predict(self.X_test)
accuracy = accuracy_score(self.y_test, y_pred)
# Calcula la curva precisión-recuperación y su área (PR-AUC)
precision, recall, _ = precision_recall_curve(self.y_test, y_pred)
pr_auc = auc(recall, precision)
# Imprime un informe detallado con otras métricas.
report = classification_report(self.y_test, y_pred, zero_division=1)
# Muestra la matriz de confusión.
confusion = confusion_matrix(self.y_test, y_pred)
self.imprimirReporte(
"Mejores hiperparámetros:\n{}\n".format(grid_search.best_params_),
"",
"PR-AUC: {}\n".format(pr_auc),
accuracy,
report,
confusion,
best_model,
"GradientBoosting en {}".format(self.archivo))
def modeloNN(
self,
units_capa1=64,
units_capa2=32,
units_capa3=16,
units_capa4=8,
optimizer='rmsprop'
):
model = Sequential()
model.add(Dense(units_capa1, input_dim=self.X_train.shape[1], activation='relu', kernel_initializer="glorot_uniform"))
model.add(Dropout(0.25))
model.add(Dense(units_capa2, activation='relu', kernel_initializer="glorot_uniform"))
model.add(Dropout(0.25))
model.add(Dense(units_capa3, activation='relu', kernel_initializer="glorot_uniform"))
model.add(Dropout(0.25))
model.add(Dense(units_capa4, activation='relu', kernel_initializer="glorot_uniform"))
model.add(Dropout(0.25))
model.add(Dense(1, activation='sigmoid'))
# Configurar el optimizador con tasa de aprendizaje específica
optimizer_instance = rmsprop_v2(learning_rate=0.001) if optimizer == 'rmsprop' else optimizer
model.compile(optimizer=optimizer_instance, loss='binary_crossentropy', metrics=['accuracy'])
return model
def clasificadorRedNeuronal(self):
# Configurar KerasClassifier usando self.modeloNN
modelo = KerasClassifier(model=partial(self.modeloNN, optimizer='rmsprop'), verbose=0)
# Definir grid de hiperparámetros
parametros = {
'epochs': [30],
'batch_size': [16]
}
grid = GridSearchCV(
estimator=modelo,
param_grid=parametros,
scoring='accuracy',
cv=3
)
grid_resultado = grid.fit(self.X_train, self.y_train)
# Obtener el modelo con los mejores hiperparámetros
mejor_modelo = grid_resultado.best_estimator_
# Hacer predicciones con el conjunto de prueba
y_pred = mejor_modelo.predict(self.X_test)
# Evaluar el modelo en el conjunto de prueba
accuracy = grid_resultado.best_score_
# Calcula la curva precisión-recuperación y su área (PR-AUC)
precision, recall, _ = precision_recall_curve(self.y_test, y_pred)
pr_auc = auc(recall, precision)
# Reporte de clasificación
report = classification_report(self.y_test, y_pred, zero_division=1)
# Matriz de Confusión
confusion = confusion_matrix(self.y_test, y_pred)
self.imprimirReporte(
"Mejores hiperparámetros:\n{}\n".format(grid_resultado.best_params_),
"",
"PR-AUC: {}\n".format(pr_auc),
accuracy,
report,
confusion,
mejor_modelo,
"MLP en {}".format(self.archivo))
def imprimirReporte(self, extra, extra2, extra3, accuracy, classification_report, confusion_matrix, modelo, titulo= "Reporte de resultados"):
fecha_y_hora = datetime.now().strftime("%Y-%m-%d %H:%M:%S")
file = open(self.reporte, "a")
file.write("----- Inicio del reporte {} -----\n".format(fecha_y_hora))
file.write("---------------------\n")
file.write("{}\n".format(titulo))
file.write("---------------------\n")
file.write(extra)
file.write("\n")
file.write(extra2)
file.write("\n")
file.write(extra3)
file.write("\n")
file.write("Precisión: {}\n".format(accuracy))
file.write("\nReporte de clasificación\n")
file.write(classification_report)
file.write("\nMatriz de confusión:\n")
file.write(str(confusion_matrix))
file.write("Validación cruzada:\n")
file.write(self.validaciónCruzada(modelo))
file.write("\n----- Fin del reporte -----\n\n")
file.close()
dataset = self.archivo
algoritmo = titulo.split(" ")[0]
tecnica = "ninguna"
self.resultado_dict["{}_{}_{}_{}".format(fecha_y_hora,dataset,tecnica,algoritmo)] = classification_report
def validaciónCruzada(self, model):
# Configura la validación cruzada de 5 pliegues
kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42)
# Realiza la validación cruzada y obtén los puntajes de precisión
scores = cross_val_score(model, self.X_train, self.y_train, cv=kf, scoring='accuracy')
mensaje = "Puntajes de precisión para cada pliegue:\n{}\n\nPrecisión media{}\nDesviación estándar de la precisión:{}\n".format(scores,scores.mean(),scores.std())
return mensaje
# Código a ejecutar
def main(self):
if(self.ok):
with open(self.archivo, 'rb') as f:
result = chardet.detect(f.read())
self.codificacion = result['encoding']
try:
self.modelos["RF"] = self.clasificadorArboles()
self.modelos["SVM"] = self.clasificadorSVM()
self.modelos["GB"] = self.clasificadorGradientBoosting()
self.modelos["MLP"] = self.clasificadorRedNeuronal()
except Exception as e:
print("error en algoritmos: {}".format(str(e)))
pass
file = open("IEEE.txt", "a")
for etiqueta, contenido in self.resultado_dict.items():
file.write("{}:\n {}\n\n".format(etiqueta, contenido))
else:
print("error al crear el algoritmo, posiblemente hay muy pocas muestras en dataset")
##Entrenamiento del modelo final en una instancia del objeto ClasificadorDepresion
objeto = ClasificadorDepresion(
archivo="selectedFeaturesDataset.csv",
reporte="reporteIEEE.txt"
)
objeto.main()
# Este es el modelo
# objeto.modelos["SVM","GB","MLP","RF"]