diff --git a/.gitignore b/.gitignore index db4561e..32ee57d 100644 --- a/.gitignore +++ b/.gitignore @@ -52,3 +52,11 @@ docs/_build/ # PyBuilder target/ + +# Mike's +*.bak +*.pyc +*~ +*.swp +bin/ +cover/ diff --git a/.travis.yml b/.travis.yml index a99c112..4ccd5ce 100644 --- a/.travis.yml +++ b/.travis.yml @@ -10,7 +10,7 @@ install: before_script: - tests/install_samtools.sh - export PATH=$PATH:$PWD/bin -script: - - nosetests --with-coverage --cover-erase --cover-package=subsamplebam +script: + - nosetests --with-coverage --cover-erase --cover-package=subsamplebam --cover-package=subsample_mindepth after_success: - coveralls diff --git a/README.md b/README.md index 369110d..cdc2da5 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -1,6 +1,12 @@ -[![Build Status](https://travis-ci.org/necrolyte2/subsamplebam.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/necrolyte2/subsamplebam) -[![Coverage Status](https://coveralls.io/repos/necrolyte2/subsamplebam/badge.png?branch=master)](https://coveralls.io/r/necrolyte2/subsamplebam?branch=master) -[![Docs](https://readthedocs.org/projects/subsamplebam/badge/?version=latest)](http://subsamplebam.readthedocs.org/en/latest/) +[![Build Status](https://travis-ci.org/averagehat/subsamplebam.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/averagehat/subsamplebam) +[![Coverage Status](https://coveralls.io/repos/averagehat/subsamplebam/badge.svg?branch=master)](https://coveralls.io/r/averagehat/subsamplebam?branch=master) + +Current solution is in subsample_mindepth.py. Travis integration has been updated. + + +# TODO +* Test with real data and confer with biologists to ensure accuracy +* Refactor implementation to allow multi-processing solution (may involve a "mop-up" method to run after re-uniting the subsampled reads) # subsamplebam @@ -86,6 +92,3 @@ You can see this in the examples above that even though ``--subsample 10`` was u they may cover many base positions. So if your average read depth is 150 and you are sub selecting at 10 depth, the first base will contain 10 depth, but position 2 will contain those 10 reads, plus potentially 10 more reads. Then the 3rd position will contain 10+10+10, and so on. -## TODO - -* Fix the issue noted above diff --git a/htslib b/htslib new file mode 160000 index 0000000..4b4349a --- /dev/null +++ b/htslib @@ -0,0 +1 @@ +Subproject commit 4b4349a60cc18e38ef78ec1344311a6a8f678c22 diff --git a/images/compiled.___780_780_bam.minimized.40.bam.png b/images/compiled.___780_780_bam.minimized.40.bam.png new file mode 100644 index 0000000..629cedc Binary files /dev/null and b/images/compiled.___780_780_bam.minimized.40.bam.png differ diff --git a/images/compiled.___780_780_bam.minimized.700.bam.png b/images/compiled.___780_780_bam.minimized.700.bam.png new file mode 100644 index 0000000..cb4ec8a Binary files /dev/null and b/images/compiled.___780_780_bam.minimized.700.bam.png differ diff --git a/images/compiled.___780_780_bam.minimized.9000.bam.png b/images/compiled.___780_780_bam.minimized.9000.bam.png new file mode 100644 index 0000000..dea780e Binary files /dev/null and b/images/compiled.___780_780_bam.minimized.9000.bam.png differ diff --git a/parallel.sh b/parallel.sh new file mode 100755 index 0000000..c1326ad --- /dev/null +++ b/parallel.sh @@ -0,0 +1,41 @@ +bamfile=$1 +depth=$2 +orphans=$3 +refs=`samtools view -H $bamfile | grep @SQ | grep -oP "SN:\K([^\t]+)"` +outdir=outputs +tmpdir=/tmp/subsampletmp +mkdir -p $tmpdir +mkdir -p $outdir +outfile=${bamfile//[\/\.]/_}.minimized.$depth +ngs="/home/AMED/michael.panciera/projects/ngs_mapper/ngs_mapper" +compiled=$outdir/compiled.${outfile}.bam; + +let i=0 +for ref in $refs; +do + let i++; + echo $1; + ( + out=${tmpdir}/${i}; #${outifile} + python subsample_mindepth.py $bamfile $ref --subsample $depth $orphans > $out.sam; + samtools view -hSb $out.sam > $out.bam; #| samtools sort - $out; samtools index $out.bam; + ) & + ref=${ref//[\/\|]/_}; + echo "$ref saved to $out.bam"; +done; +wait + +if [ $i -ge 2 ]; +then + echo "merging files." + samtools merge -f $compiled $tmpdir/[0-9]*.bam ; +else + mv $tmpdir/$i.bam $compiled +fi + +echo "bam files compiled in $outdir/compiled.${outfile}.bam. Now compiling and plotting"; +samtools sort $compiled $compiled; +samtools index $compiled; +python $ngs/bam_to_qualdepth.py $compiled > $compiled.json +python $ngs/graph_qualdepth.py $compiled.json -o $compiled.png +rm $tmpdir/[0-9]*.[sb]am; diff --git a/requirements.txt b/requirements.txt index 5c17384..d4326e2 100644 --- a/requirements.txt +++ b/requirements.txt @@ -1,2 +1,3 @@ -biopython argparse +numpy +future diff --git a/scripts/min.sh b/scripts/min.sh new file mode 100755 index 0000000..585a23b --- /dev/null +++ b/scripts/min.sh @@ -0,0 +1,12 @@ +#!/bin/bash +# run my minimization script and create the plots +cd .. +dir="foo" +mkdir -p $dir +tmp=${dir}/${2}.min.${6} +echo $tmp +echo `pwd` +ngs="/home/AMED/michael.panciera/projects/ngs_mapper/ngs_mapper" +python subsample_mindepth.py $1 $2 $3 $4 $5 $6 | samtools view -hSb - | samtools sort - $tmp; samtools index $tmp.bam; +python $ngs/bam_to_qualdepth.py $tmp.bam > $tmp.json +python $ngs/graph_qualdepth.py $tmp.json -o $tmp.png diff --git a/scripts/random.sh b/scripts/random.sh new file mode 100755 index 0000000..78d77a4 --- /dev/null +++ b/scripts/random.sh @@ -0,0 +1,19 @@ +#!/bin/bash +# run the subsamplebam solution +cd .. +mkdir random +ngs="/home/AMED/michael.panciera/projects/ngs_mapper/ngs_mapper" +bamfile="../780/780.bam" +refid=`samtools view -H ../780/780.bam | grep @SQ | head -1 | grep -oP "SN:\K([^\t]+)"` +seqlength=`samtools view -H ../780/780.bam | grep @SQ | head -1 | grep -oP "LN:\K([0-9]+)"` +tmp="random/780.subsampled" + +echo ${refid}:1-${seqlength} Trying + +subsamplebam $bamfile ${refid}:1-${seqlength} --subsample 10 | samtools view -hSb - | samtools sort - $tmp; samtools index ${tmp}.bam; +python $ngs/bam_to_qualdepth.py $tmp.bam > $tmp.json +python $ngs/graph_qualdepth.py $tmp.json -o $tmp.png + + + +#samtools view -hSb - | samtools sort - $tmp; samtools index ${tmp}.bam; diff --git a/setup.py b/setup.py index da808a4..a0abca6 100755 --- a/setup.py +++ b/setup.py @@ -5,7 +5,7 @@ setup( name = 'subsamplebam', version = __version__, - py_modules = ['subsamplebam'], + py_modules = ['subsamplebam', 'subsample_mindepth'], setup_requires = [ 'nose', 'python-coveralls' diff --git a/subsample_mindepth.py b/subsample_mindepth.py new file mode 100644 index 0000000..338059d --- /dev/null +++ b/subsample_mindepth.py @@ -0,0 +1,206 @@ +from __future__ import print_function +import sys +import numpy as np +import subsamplebam +import subprocess as sp +import re + +''' Python3 compatibility ''' + +from past.builtins import map, xrange, filter + +class CommonEqualityMixin(object): + def __eq__(self, other): + return (type(other) is type(self) and self.__dict__ == other.__dict__) + + def __ne__(self, other): + return not self.__eq__(other) + +''' +1. get all sequences which could overlap under_index, and which have not already been selected. (how get these, by using samtools view again? or store in memory? only need a UNIQUE identifier and the sequence length) +2. choose the sequence which has the longest length after under_index. This will deal with the situation where you picked a short sequence which didn't cover a coming index, before you knew you wouldn't need it. +''' + +def get_raw_reads(bamfile, regionstr=""): + ''' + :param str bamfile: path to input file + :param str regionstr: the seq id to select, followed by the region to look up, seperated by colon. i.e.: + :1-1000 + :return a list of sequences from the output of `samtools view` + ''' + return list(subsamplebam.samview(bamfile, regionstr)) + +def parse_alignment(raw_view): + ''' + :param str raw_view: a single sequence (line as displayed by `samtools view` + :return: An Alignment object including the QNAME, POS, SEQ and whether or not it's an orphan. + ''' + fields = raw_view.split() + flag = int(fields[1]) + qname, pos, seq = fields[0], int(fields[3]), fields[9] + return Alignment(raw_view, qname, pos, seq, flag) + +def get_alignments(bamfile, regionstr): + return [parse_alignment(string) for string in get_raw_reads(bamfile, regionstr)] + +class DepthMatrix(CommonEqualityMixin): + ''' + Keep track of the picked alignments (seq_matrix) and .depth_array, representing the coverage at each sequence position. + ''' + + def __init__(self, min_depth, allow_orphans=False): + self.seq_matrix = [[]] + #self.depth_array = np.zeros(ref_length) + self.min_depth = min_depth + self.allow_orphans = allow_orphans + + + def allow(self, seq): + if self.allow_orphans: + return True + else: + return not seq.orphan + + def get_candidate_sequences(self, under_index): + ''' + :param int under_index: the current position in the matrix which is under-covered. + Candidates have not been used already, overlap the current index, and are not "orphan" or "anomalous" reads. + orphaned/anomalous reads don't get spotted by default mpileup command. see https://github.com/VDBWRAIR/ngs_mapper/issues/112 + ''' + #TODO: have this only look backwards until reach under-covered index + start = max(under_index - self.max_seq_length, 0) + sub_matrix = self.seq_matrix[start:under_index+1] + '''flatten the matrix''' + prev_seqs = [seq for row in sub_matrix for seq in row] + return filter(lambda seq: seq.overlap >= under_index and self.allow(seq) and not seq.picked, prev_seqs) + + def yield_greatest_overlaps(self, under_index, num_needed): + ''' + @side-effect: sequences are set to "picked" when they are yielded by this function. + :param int under_index: the position on the reference that is under minimum depth. + :param int num_needed: the amount the overlap is under the minimum depth + :return (yield) the sequence with the greatest overlap, which is a candidate. + ''' + candidate_sequences = self.get_candidate_sequences(under_index) + matches = 0 + while matches < num_needed and candidate_sequences: + # could instead keep sequences in order sorted by overlap + farthest_overlap_seq = max(candidate_sequences, key=lambda seq: seq.overlap) + candidate_sequences.remove(farthest_overlap_seq) + farthest_overlap_seq.pick() + matches += 1 + yield farthest_overlap_seq + def pickreads(self, pos, needed_depth): + ''' + 1. get all sequences which could overlap under_index, and which have not already been selected. (how get these, by using samtools view again? or store in memory? only need a UNIQUE identifier and the sequence length) + 2. choose the sequence which has the longest length after under_index. This will deal with the situation where you picked a short sequence which didn't cover a coming index, before you knew you wouldn't need it. + :param int pos: the current position which needs to be covered. + :param int needed_depth: The amount of coverage needed to reach the minimum depth. + :return True if the minimum depth was met at position pos, False otherwise. + ''' + next_sequences = list(self.yield_greatest_overlaps(pos, needed_depth)) + if not next_sequences: # no matches found + return False + ''' This doesn't work because it returns a flat list of depths starting at index 0, where in reality these reads + Can start at different positions behind the current position.''' + next_depths = self.get_depths(next_sequences) + self.depth_array += next_depths + #sys.stderr.write("depth {0} at pos {1}\n".format(str(len(next_sequences)), str(pos))) + if len(next_sequences) > needed_depth: + raise Exception("Too many sequences retured") + return len(next_sequences) == needed_depth + + def get_depths(self, reads): + ''' + :param list reads: Alignment objects that have been picked. + :return: a numpy array representing the total depths or overlap of these alignments. + ''' + #TODO:Needlessly creates a depth_array of equal size to self.depth_array. Also needlessly slow. + depths = np.zeros(len(self.depth_array)) + #import ipdb; ipdb.set_trace() + for seq in reads: + ''' Even if a sequence would overlap past the length of depth-array, we don't include that in depth-array. + the numpy arrays must be the same size in order to add them. ''' + i, j = seq.pos, min(len(depths), seq.overlap)# +1) + depths[i:j] += np.array([1 for overlap in xrange(i, j)]) + return depths + + def make_seq_matrix(self, bamfile, regionstr): + ''' + :param str bamfile: path to file + :param str regionstr: reference sequence and length as listed in .bam header i.e. :1-1000 + Parse a bam file using sam tools, and store the alignments as a 2d matrix, where each row is a posiiton in the reference sequence. + ''' + #import ipdb; ipdb.set_trace() + all_alignments = get_alignments(bamfile, regionstr) + max_pos = max([seq.pos for seq in all_alignments]) + max_overlap = max([seq.overlap for seq in all_alignments]) + self.depth_array = np.zeros(max_overlap) + '''initialize sequence matrix as a 2D array in order of position.''' + self.seq_matrix = [ [seq for seq in all_alignments if seq.pos == i] for i in xrange(max_pos+1)] + self.max_seq_length = max([seq.seq_length for seq in all_alignments]) + + def minimize_depths(self): + ''' + Trim self.seq_matrix to minimize coverage overflow. + For each position in the reference sequence, pick reads until the minimum depth is met if possible. + ''' + #import ipdb; ipdb.set_trace() + for pos, depth in enumerate(self.depth_array): + if depth < self.min_depth: + needed_depth = self.min_depth - depth + depth_met = self.pickreads(pos, needed_depth) + #sys.stderr.write("depth was {0}met.\n".format("" if depth_met else "NOT ")) + + +class Alignment(CommonEqualityMixin): + ''' Store info for the alignment, created from parsing the results of `samtools view`. See parse_alignment method. ''' + + def __init__(self, string, qname, pos, seq, flag): + self.qname, self.pos, self.seq = qname, pos, seq + self.picked = False + self.string = string + self.orphan = self.is_orphan(flag) + + ''' return true if the pair is not mapped. This is necessary to maintain consistency with `samtools mpileup`''' + def is_orphan(self, flag): + return not flag & 0x2 + + @property + def seq_length(self): + return len(self.seq) + + @property + def overlap(self): + return self.pos + self.seq_length + + def pick(self): + self.picked = True + + def __repr__(self): + #return "pos: {0}, overlap {1} \n seq {2} \n {3}".format(self.pos, self.overlap, self.seq, self.string) + return "pos: {0}, overlap {1} ".format(self.pos, self.overlap) + +def flatten_and_filter_matrix(matrix): + return [seq.string for row in matrix for seq in row if seq.picked] + +def main(): + ''' + Parse the sam view, initialize the DepthMatrix, and trim the sequence matrix using minimize_depths. + Then, ouptut the results (as a sam view) to stdout. + ''' + #TODO: need to handle case where fasta file does not span entire reference genome; depth array should be limited in that case to the largest overlap + args = subsamplebam.parse_args(wrapper=False) + sys.stderr.write(str(args)+'\n') +# ref_length = int(args.regionstr.split(':')[-1].split('-')[-1]) +# region_str = args.regionstr.split(':')[0] + matrix = DepthMatrix(args.subsample, allow_orphans=args.count_orphans) + matrix.make_seq_matrix(args.bamfile, args.refseq) + matrix.minimize_depths() + ''' Flatten the matrix ''' + sampled_seqs = flatten_and_filter_matrix(matrix.seq_matrix) + '''Print results to stdout as a sam view (.sam file)''' + subsamplebam.make_subselected_bam(args.bamfile, sampled_seqs) + +if __name__ == "__main__": + main() diff --git a/subsamplebam.py b/subsamplebam.py index 67eee5e..58372d9 100755 --- a/subsamplebam.py +++ b/subsamplebam.py @@ -1,5 +1,4 @@ -#!/usr/bin/env python -# -*- coding: utf-8 -*- +#!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # Handle SIGPIPE signals correctly from signal import signal, SIGPIPE, SIG_DFL @@ -15,21 +14,32 @@ import shlex import os.path import multiprocessing +import numpy as np -from Bio import SeqIO +''' Python3 compatibility ''' -def parse_args(): +from past.builtins import xrange + +def parse_args(wrapper=False): parser = argparse.ArgumentParser() parser.add_argument( 'bamfile' ) - parser.add_argument( - 'regionstr', - default=None, - help='Region string to do subsampleing on ref with' - ) + if not wrapper: + parser.add_argument( + 'refseq', + default=None, + help='name of the reference sequenceto do subsampleing on ' + ) + ''' reference lenght isn't necessary to use samtools view ''' +# parser.add_argument( +# 'reflength', +# default=None, +# type=int, +# help='Length of the reference sequence' +# ) parser.add_argument( '--subsample', @@ -38,6 +48,14 @@ def parse_args(): help='What depth to try and subsample to' ) + parser.add_argument( + '-A', '--count-orphans', + action='store_true', + help='Allow orphan/unpaired reads.' + ) + + + return parser.parse_args() class MinimumDepthNotAvailable(Exception): pass @@ -60,15 +78,6 @@ def randomly_select_reads_from_samview(bamfile, regionstr, n): raise MinimumDepthNotAvailable('Depth for {0} is only {1}'.format(regionstr, len(sview))) return newselection -def reference_info(reffile): - ''' - Hash reference id's with their lengths - ''' - refinfo = {} - for rec in SeqIO.parse(reffile, 'fasta'): - refinfo[rec.id] = len(str(rec.seq)) - return refinfo - def parallel_randomly_select_reads_from_samview(args): try: return randomly_select_reads_from_samview(*args) @@ -116,6 +125,12 @@ def make_subselected_bam(bamfile, uniquereads): for line in uniquereads: sys.stdout.write(line) + +def reads_by_pos(reads, max_pos): + #def is_at_pos(pos): return read['pos'] == pos + for pos in xrange(max_pos): + yield [read for read in reads if read['pos'] == pos] + def samview(bamfile, regionstr): ''' Just return iterator over samtools view bamfile regionstr diff --git a/tests/ecoli.bam b/tests/ecoli.bam new file mode 100644 index 0000000..76459d0 Binary files /dev/null and b/tests/ecoli.bam differ diff --git a/tests/ecoli.bam.bai b/tests/ecoli.bam.bai new file mode 100644 index 0000000..6015a55 Binary files /dev/null and b/tests/ecoli.bam.bai differ diff --git a/tests/install_samtools.sh b/tests/install_samtools.sh index 34e7153..5225dbd 100755 --- a/tests/install_samtools.sh +++ b/tests/install_samtools.sh @@ -3,6 +3,11 @@ set -ev prefix=$PWD version=1.1 +if [ -e bin/samtools ] +then + echo "${PWD}/bin/samtools already exists so not recompiling" + exit 0 +fi git clone https://github.com/samtools/htslib.git git clone https://github.com/samtools/samtools.git cd samtools diff --git a/tests/test40.sam b/tests/test40.sam new file mode 100644 index 0000000..e9e09e0 --- /dev/null +++ b/tests/test40.sam @@ -0,0 +1,570 @@ +@HD VN:1.0 SO:coordinate +@SQ SN:gi|110640213|ref|NC_008253.1| LN:4938920 +@PG ID:bowtie2 PN:bowtie2 VN:2.1.0 +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_2_451_1:0:0_1:0:0_12b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 2 42 70M * 0 0 GCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTCAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A24 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_4_510_1:0:0_2:0:0_114/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 4 42 70M * 0 0 TTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATCTGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A43 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_5_452_2:0:0_1:0:0_1d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 5 42 70M * 0 0 TTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTGTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTGTGATAGCAGCTTCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31C23C14 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_6_397_0:0:0_0:0:0_2c1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 6 42 70M * 0 0 TTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_7_500_3:0:0_1:0:0_250/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 7 40 70M * 0 0 TCATTCTGAGTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGCTTAAACAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C27A5A26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_9_557_0:0:0_2:0:0_13d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 9 42 70M * 0 0 ATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_10_554_1:0:0_1:0:0_2a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 10 42 70M * 0 0 TTCTGACTGCAACGGTCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G54 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_11_515_1:0:0_1:0:0_335/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 11 42 70M * 0 0 TCTGACTGCACCGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A59 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_11_524_0:0:0_3:0:0_3a4/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 11 42 70M * 0 0 TCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_13_500_1:0:0_0:0:0_269/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 13 42 70M * 0 0 TGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATAAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33T36 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_14_510_2:0:0_0:0:0_39f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 14 42 70M * 0 0 GACTGCCACGGGCAAAATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A8T54 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_15_598_2:0:0_0:0:0_20c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 15 42 70M * 0 0 ACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGAAAGCAGCTTCTGAACAGGTTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:49T14T5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_15_504_2:0:0_1:0:0_3b3/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 15 42 70M * 0 0 ACTGCAACGGGCAATATGTGTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCATCTGAACTGGTTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19C36T13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_16_534_1:0:0_3:0:0_276/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 16 42 70M * 0 0 CTGCAACGGGCCATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11A58 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_17_522_1:0:0_0:0:0_1b5/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 17 42 70M * 0 0 TGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGACCTGGTTACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60A9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_19_487_2:0:0_1:0:0_309/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 19 42 70M * 0 0 CAACGGGCAATATTTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACAGGTTACCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G46T9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_23_469_3:0:0_2:0:0_117/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 23 40 70M * 0 0 GGGCAATATTTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATCGGAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9G32A1C25 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_24_566_3:0:0_1:0:0_18c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 24 40 70M * 0 0 GGCACTATGTCTCTGTGTTGATTAACAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4A13G6A44 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_27_548_1:0:0_2:0:0_23f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 27 42 70M * 0 0 AATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCAGAACTGGTTACCTGCCGTGAGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_28_610_2:0:0_1:0:0_136/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 28 42 70M * 0 0 ATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGACTGATAGGAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31T7C30 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_30_626_4:0:0_2:0:0_25f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 30 40 70M * 0 0 ATGTCTCTGTGTGTATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCTTGATTAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:13G47G3G3A0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_32_563_1:0:0_0:0:0_359/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 32 42 70M * 0 0 GTCTCTGTGTGTATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11G58 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_33_511_1:0:0_2:0:0_2a7/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 33 42 70M * 0 0 TCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTTAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_34_468_3:0:0_2:0:0_252/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 34 40 70M * 0 0 CTCTGTGTGGATTACAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGCACTGGTTAGCTGCCGTGAGTAAATTAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14A27A8C18 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_36_523_0:0:0_0:0:0_237/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 36 42 70M * 0 0 CTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_36_535_3:0:0_2:0:0_3d5/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 36 40 70M * 0 0 CTGTTTTGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCCGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G1G25A37 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_43_601_3:0:0_0:0:0_91/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 43 40 70M * 0 0 GATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCGGTGAGTACATTAAAATTTTATA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:47C7A13T0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_44_590_1:0:0_1:0:0_e0/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 44 42 70M * 0 0 ATTAAAAAAAGAGTGACTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T54 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_45_520_0:0:0_3:0:0_119/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 45 42 70M * 0 0 TTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_48_572_2:0:0_0:0:0_13e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 48 42 70M * 0 0 AAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCATCTGCACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T4A41 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_49_557_2:0:0_2:0:0_38d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 49 42 70M * 0 0 AAAAAGCGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCTTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:6A35G27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_51_577_1:0:0_3:0:0_61/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 51 42 70M * 0 0 AAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTGTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C47 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_51_548_1:0:0_3:0:0_151/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 51 42 70M * 0 0 AAAGAGTGACTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8T61 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_51_525_0:0:0_1:0:0_3ce/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 51 42 70M * 0 0 AAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_52_511_2:0:0_3:0:0_58/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 52 42 70M * 0 0 AAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTCAAATTTTATTTACTTAGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:50A10G8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_52_593_1:0:0_1:0:0_96/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 52 42 70M * 0 0 AAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTTAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41G28 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_55_554_0:0:0_1:0:0_172/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 55 42 70M * 0 0 AGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_55_552_3:0:0_1:0:0_34e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 55 40 70M * 0 0 AGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTCAATTAAAAATTTAATGACTTAGGTCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:42A8T4T13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_57_612_1:0:0_0:0:0_124/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 57 42 70M * 0 0 TGTCTGATAGCAGCTACTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T54 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_58_571_2:0:0_2:0:0_a4/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 58 42 70M * 0 0 GTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGCTTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36A0G32 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_71_618_1:0:0_0:0:0_1a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 71 42 70M * 0 0 TTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAACTTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A41 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_72_554_1:0:0_0:0:0_da/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 72 42 70M * 0 0 TCTGAACTGGTTACCAGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T54 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_74_551_1:0:0_1:0:0_f5/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 74 42 70M * 0 0 TGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACATTAACCAATAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58T11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_76_551_4:0:0_5:0:0_203/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 76 40 70M * 0 0 AACTGGTTACCTGCGGTGAGTAAATTCAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAACTACTTTACCCAATATAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14C11A25A7A9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_77_545_2:0:0_2:0:0_222/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 77 42 70M * 0 0 ACTGGTTACCTGCCGAGAGTAAATTAAAATTTTATTGAGTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T22C31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_78_562_2:0:0_3:0:0_1fe/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 78 42 70M * 0 0 CTGGTTACCTGCGGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAACTACTTTAACCAATATAGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12C37A19 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_79_560_0:0:0_1:0:0_15d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 79 42 70M * 0 0 TGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_80_595_2:0:0_2:0:0_1f6/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 80 42 70M * 0 0 GGTTACCTGCCGTGAGTAAATAAAAATTTTCTTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21T8A39 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_81_703_4:0:0_0:0:0_88/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 81 40 70M * 0 0 GTTACCAGCCGTGATTAAATAAAAATTTTATTGACATAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:6T7G5T14T34 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_81_611_0:0:0_2:0:0_370/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 81 42 70M * 0 0 GTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_83_611_1:0:0_0:0:0_15e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 83 42 70M * 0 0 TACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACAAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42T27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_83_630_2:0:0_2:0:0_33d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 83 42 70M * 0 0 TACGTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGACACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C34T31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_85_579_1:0:0_2:0:0_387/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 85 42 70M * 0 0 CCTGCCGTGAGTAAATAAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16T53 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_86_550_0:0:0_0:0:0_c0/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 86 42 70M * 0 0 CTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_87_560_0:0:0_1:0:0_ec/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 87 42 70M * 0 0 TGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_89_530_2:0:0_2:0:0_162/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 89 42 70M * 0 0 CGGTGAGTAAATTAAAATTTTAATGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C20T47 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_92_693_1:0:0_2:0:0_219/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 92 42 70M * 0 0 TTAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1G68 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_93_658_1:0:0_0:0:0_36d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 93 42 70M * 0 0 GAGTAAATTAAAATTTTATTTACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20G49 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_97_534_3:0:0_1:0:0_3e1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 97 40 70M * 0 0 AAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTCAATACTTACACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:29A7T0A31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_98_634_0:0:0_1:0:0_6f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 98 42 70M * 0 0 AATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_100_642_2:0:0_2:0:0_a5/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 100 42 70M * 0 0 TTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCACTAAAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40A2T26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_101_581_1:0:0_2:0:0_116/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 101 42 70M * 0 0 TAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTATAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T37 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_102_482_1:0:0_1:0:0_42/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 102 42 70M * 0 0 AAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTAAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T37 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_102_593_1:0:0_1:0:0_10e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 102 42 70M * 0 0 AAAATTTTATTGACTTAGGTCACTCAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24A45 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_103_566_0:0:0_2:0:0_247/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 103 42 70M * 0 0 AAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_103_574_2:0:0_2:0:0_2c8/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 103 42 70M * 0 0 AAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATCCTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACCGATAAAAATTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27A30A11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_112_627_3:0:0_3:0:0_338/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 112 40 70M * 0 0 TGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGCTAAAAATAAGAGAGTACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51A7T1C8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_114_711_1:0:0_0:0:0_180/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 114 42 70M * 0 0 ACTTAGGTCAGTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10C59 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_114_712_0:0:0_3:0:0_2a0/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 114 42 70M * 0 0 ACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_116_639_2:0:0_1:0:0_f7/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 116 42 70M * 0 0 TTAGGTCACTAAATACTTTAACCACTATAGGCATAGCGCACAGACATATAAAAATTACAGAGTACACAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A21G23 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_116_735_0:0:0_2:0:0_10a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 116 42 70M * 0 0 TTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_117_640_1:0:0_2:0:0_d5/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 117 42 70M * 0 0 TAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTAGAGAGTACACAACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56C13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_118_623_3:0:0_3:0:0_15a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 118 40 70M * 0 0 AGGTCACAAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGGGCACCGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7T26C4A30 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_119_681_2:0:0_3:0:0_fe/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 119 42 70M * 0 0 GGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGGACAGACAGATAAAAATTACAGAGTAGACAACATC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35C25C8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_120_622_2:0:0_0:0:0_123/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 120 42 70M * 0 0 GTCACTAAATCCTTTAACCAATAAAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10A12T46 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_121_651_1:0:0_0:0:0_1d4/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 121 42 70M * 0 0 TCACTAAATACTATAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12T57 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_123_726_3:0:0_1:0:0_1e1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 123 40 70M * 0 0 ACTAAATAGTATAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACACCATCCATG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8C1T50A8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_124_704_1:0:0_1:0:0_b9/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 124 42 70M * 0 0 CTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACATACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34G35 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_126_639_0:0:0_3:0:0_1b7/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 126 42 70M * 0 0 AAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_128_647_2:0:0_1:0:0_171/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 128 42 70M * 0 0 ATACATTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACCTCCATGAAACG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4T53A11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_132_676_2:0:0_0:0:0_231/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 132 42 70M * 0 0 TTTAACCAATATAGGCAAAGCTCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17T3G48 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_133_597_0:0:0_1:0:0_3e3/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 133 42 70M * 0 0 TTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_135_623_2:0:0_2:0:0_44/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 135 42 70M * 0 0 AACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATAACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATAAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36T29T3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_137_654_1:0:0_1:0:0_83/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 137 42 70M * 0 0 CCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATCAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28A41 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_140_691_2:0:0_6:0:0_2fd/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 140 42 70M * 0 0 ATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATAAGCAGCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61T4C3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_140_730_0:0:0_0:0:0_2ff/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 140 42 70M * 0 0 ATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_146_691_1:0:0_0:0:0_18/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 146 42 70M * 0 0 GCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCCTTAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:65A4 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_148_623_2:0:0_2:0:0_3d1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 148 42 70M * 0 0 ATAGCGCACAGACAGATAAAAATAACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACGACCATTACCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23T35C10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_149_599_2:0:0_0:0:0_3d8/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 149 42 70M * 0 0 TAGCGGACAGACAGATAAAAATAACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C16T47 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_150_579_1:0:0_4:0:0_234/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 150 42 70M * 0 0 AGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGGATTAGCACCACCATTACCACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48C21 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_151_618_3:0:0_0:0:0_8d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 151 40 70M * 0 0 GCGCACAGACAGATCAAAATTCCAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14A6A47A0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_151_702_0:0:0_1:0:0_d3/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 151 42 70M * 0 0 GCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_152_730_2:0:0_1:0:0_25b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 152 42 70M * 0 0 CGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCGATGAACCGCATTAGCACCACCATTACCACCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37C5A26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_153_579_2:0:0_2:0:0_52/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 153 42 70M * 0 0 GCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACAGAACATCCATGAAACGCATTATCACCACCATTACCACCACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:29C20G19 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_153_666_1:0:0_2:0:0_56/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 153 42 70M * 0 0 GCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTAGACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C42 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_154_717_0:0:0_1:0:0_b7/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 154 42 70M * 0 0 CACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_156_629_3:0:0_4:0:0_71/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 156 40 70M * 0 0 CAGACAGATAAAAAATACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCCTTATCACCACCATTACCACCACCATC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14T28A3G22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_158_623_1:0:0_1:0:0_1e7/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 158 42 70M * 0 0 GACAGATAAAAATTACAGAGTACAGAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24C45 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_160_638_1:0:0_1:0:0_1a9/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 160 42 70M * 0 0 CAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTCGCACCACCATTACCACCACCATCACCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_160_654_0:0:0_3:0:0_25d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 160 42 70M * 0 0 CAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_162_724_1:0:0_3:0:0_230/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 162 42 70M * 0 0 GATAAAAATTACAGAGTACACAACAACCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T44 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_164_638_0:0:0_0:0:0_11c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 164 42 70M * 0 0 TAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_167_647_0:0:0_0:0:0_81/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 167 42 70M * 0 0 AAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_167_677_0:0:0_0:0:0_89/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 167 42 70M * 0 0 AAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_167_662_1:0:0_1:0:0_1fd/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 167 42 70M * 0 0 AAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCAGCATTACCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_171_630_1:0:0_2:0:0_206/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 171 42 70M * 0 0 TACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTCCCACAGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_178_664_0:0:0_1:0:0_26d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 178 42 70M * 0 0 TACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_179_697_0:0:0_0:0:0_317/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 179 42 70M * 0 0 ACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_179_727_2:0:0_1:0:0_32a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 179 42 70M * 0 0 AGACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTCCCACAGGTAACGGTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C51A16 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_180_734_2:0:0_2:0:0_28b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 180 42 70M * 0 0 CACAAGATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAAGGGTGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5C57C6 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_182_647_0:0:0_1:0:0_24b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 182 42 70M * 0 0 CAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_185_638_0:0:0_2:0:0_394/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 185 42 70M * 0 0 CATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_185_698_1:0:0_2:0:0_398/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 185 42 70M * 0 0 CATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATAACCACAGGTAACGGTGCGGGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46T23 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_189_750_2:0:0_1:1:0_10f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 189 42 70M * 0 0 CATGAAACGCATTAGCAGCACCATTACCACCACCATCCCCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17C19A32 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_189_672_1:0:0_1:0:0_189/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 189 42 70M * 0 0 CATGAAACGCATTAGCAGCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17C52 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_190_751_3:0:0_2:1:0_78/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 190 40 70M * 0 0 ATGAAACGCATTAGCACCAGGATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGAGCGGGCTGACGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:19C0C35T13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_190_679_2:0:0_2:0:0_31e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 190 42 70M * 0 0 ATGAAACGCATTAGCACCACCATTACGACCACCATCACGATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26C11C31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_192_751_0:0:0_0:1:0_11a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 192 42 70M * 0 0 GAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_196_761_4:0:0_2:1:0_d2/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 196 40 70M * 0 0 CTCATTAGCACCACCATAACCCCCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGCCGCGTACAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1G15T3A37A10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_198_682_1:0:0_3:0:0_3c1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 198 42 70M * 0 0 CATTAGCACCACCCTTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13A56 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_202_756_3:0:0_2:1:0_a0/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 202 40 70M * 0 0 AGCACCACCATTACCACCACGATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACTCGTAGAGGAAACAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20C34G4C9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_202_651_1:0:0_1:0:0_152/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 202 42 70M * 0 0 AGCACCAGCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C62 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_205_736_2:0:0_3:1:0_60/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 205 42 70M * 0 0 ACCACCATTACCACCACCATCACGATTAGCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C4C41 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_205_805_2:0:0_1:1:0_272/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 205 42 70M * 0 0 ACCACCATTACCACCACCATCCCCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21A47A0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_210_743_2:0:0_1:1:0_2/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 210 42 70M * 0 0 CATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGAAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACCGAAAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T31A7 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_210_753_2:0:0_2:1:0_1f4/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 210 42 70M * 0 0 CATTACCACCACCATCACCCTTACCACAGTTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19A9G40 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_215_799_2:0:0_4:1:0_a9/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 215 42 70M * 0 0 CCACCCCCATCAGCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5A6C57 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_217_714_3:0:0_2:0:0_62/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 217 40 70M * 0 0 ACCACCATCACCATTACGACAGGTAACGGTGCGGGCATACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:17C18T0G32 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_217_764_1:0:0_4:1:0_107/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 217 42 70M * 0 0 ACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAACAGCCCGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61A8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_220_640_2:0:0_1:0:0_238/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 220 42 70M * 0 0 ACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGTCTGACGCGTCCAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G9A28 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_221_725_0:0:0_0:0:0_3c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 221 42 70M * 0 0 CCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_221_736_2:0:0_0:1:0_135/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 221 42 70M * 0 0 CCATGACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGACACACAGAAAAAAGCCCGCACCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:4C41A23 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_221_748_1:0:0_1:1:0_33b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 221 42 70M * 0 0 CCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGGGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C42 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_222_743_0:0:0_1:1:0_2bd/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 222 42 70M * 0 0 CATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_223_808_0:0:0_1:0:0_286/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 223 42 70M * 0 0 ATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_224_721_0:0:0_3:0:0_35/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 224 42 70M * 0 0 TCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_226_723_1:0:0_1:0:0_3b6/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 226 42 70M * 0 0 ACCATTCCCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A63 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_228_774_1:0:0_2:1:0_1bd/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 228 42 70M * 0 0 CATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAATCCCGCACCTGACAGTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52G17 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_229_750_2:0:0_2:1:0_2aa/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 229 42 70M * 0 0 ATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACTCGTACAGGAAACACAGAACAAAGCCCGCACCTGACAGTGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28G18A22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_230_796_0:0:0_0:1:0_1e6/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 230 42 70M * 0 0 TTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_232_755_3:0:0_2:1:0_3ab/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 232 40 70M * 0 0 ACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGCCGCGTACAGGAAACACAGAAAAACGCCGGCACCTGACAGTGCGGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23A23A3C18 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_234_726_1:0:0_0:0:0_102/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 234 42 70M * 0 0 CACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAACAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_236_770_1:0:0_1:1:0_140/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 236 42 70M * 0 0 CAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAACAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41A28 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_237_797_1:0:0_0:1:0_b5/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 237 42 70M * 0 0 AGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAACAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39A30 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_237_734_2:0:0_2:0:0_324/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 237 42 70M * 0 0 AGGTAACGGTGCGGGCTGACGCTTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACCGTGCGGGCTTTTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22G33A13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_241_756_2:0:0_1:1:0_164/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 241 42 70M * 0 0 AACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAACAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37A31C0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_248_737_3:0:0_3:1:0_3b1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 248 40 70M * 0 0 CGGGCTGACGCGAACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACATTGCGTGCTTTTTTTTCGACCAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12T33G4G18 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_249_816_1:0:0_4:0:0_4f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 249 42 70M * 0 0 GGGCTGACGCGTACAGGAAAGACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20C49 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_249_775_2:0:0_0:1:0_21f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 249 42 70M * 0 0 GGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAATCCCGCACCTGAGAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G11C26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_250_712_1:0:0_0:0:0_291/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 250 42 70M * 0 0 GGCTGACGCGTACAGGAAACAGAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21C48 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_252_697_0:0:0_2:0:0_f3/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 252 42 70M * 0 0 CTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_255_785_2:0:0_0:1:0_10/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 255 42 70M * 0 0 ACGCGTAGAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTATTTTTTCGACCAAAGGTAACG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7C40T21 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_255_713_3:0:0_1:0:0_245/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 255 40 70M * 0 0 ACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAATCCCGCACGTGACAGAGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25G7C6T29 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_257_848_2:0:0_1:0:0_8b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 257 42 70M * 0 0 GCGTACAGGAAACACCGAAAAAAGCCCGCACGTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15A15C38 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_258_784_1:0:0_0:1:0_240/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 258 42 70M * 0 0 CGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGAGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37T32 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_259_752_2:0:0_3:1:0_7a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 259 42 70M * 0 0 GTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCTCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAACGGTAACGAGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G32A11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_259_822_1:0:0_2:0:0_1ea/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 259 42 70M * 0 0 GTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGAGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_262_845_3:0:0_1:0:0_df/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 262 40 70M * 0 0 CAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACCGTTCTGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31A2G1G33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_266_818_1:0:0_2:0:0_3db/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 266 42 70M * 0 0 AAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGTGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:33G36 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_268_699_1:0:0_0:0:0_12a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 268 42 70M * 0 0 ACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCACAGGTAACGAGGTAACAACCAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:48A21 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_269_799_3:0:0_2:1:0_c8/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 269 40 70M * 0 0 CACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGCCCCAAGGTAACGCGGTAACAACCATG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:43A2A9A13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_269_695_2:0:0_0:0:0_3b2/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 269 42 70M * 0 0 CACAGAAAACAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGTTAACGAGGTAACAACCATG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A40G19 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_273_783_1:0:0_2:1:0_57/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 273 42 70M * 0 0 GAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGGTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:28C41 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_275_840_1:0:0_1:0:0_13f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 275 42 70M * 0 0 AAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGTCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G44 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_279_808_0:0:0_2:0:0_1cd/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 279 42 70M * 0 0 AGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_280_700_1:0:0_1:0:0_ce/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 280 42 70M * 0 0 GCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTATTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25T44 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_280_792_1:0:0_3:1:0_161/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 280 42 70M * 0 0 GCCCGCACCTGACAGTTCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G53 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_280_830_1:0:0_0:0:0_212/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 280 42 70M * 0 0 GCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCCTGCGAGTGTTGAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56A13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_284_791_1:0:0_1:1:0_16f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 284 42 70M * 0 0 GCACCTGACAGTGCTGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14G55 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_284_762_2:0:0_1:1:0_221/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 284 42 70M * 0 0 GCACCTGACAGAGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGATC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T55T2 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_284_792_0:0:0_3:1:0_25c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 284 42 70M * 0 0 GCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_285_838_2:0:0_1:0:0_2d7/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 285 42 70M * 0 0 CACCTGACAGTGCGGGCATTTTTTACGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17T6T45 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_286_812_0:0:0_1:0:0_2ce/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 286 42 70M * 0 0 ACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_289_814_0:0:0_2:0:0_17a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 289 42 70M * 0 0 TGACAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_292_761_2:0:0_0:1:0_fa/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 292 42 70M * 0 0 CAGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTCACAACCATGCGAGTGATGAAGTTCGGCGGTAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37A15T16 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_293_822_2:0:0_1:0:0_e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 293 42 70M * 0 0 AGTGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAAGGAGGTAACAACCATGGGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30C15C23 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_295_724_0:0:0_0:0:0_c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 295 42 70M * 0 0 TGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_295_789_2:0:0_2:1:0_4d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 295 42 70M * 0 0 TGCGGGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGCTTGTTGAAGTTCGGCGGTACATC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:46A0G22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_299_788_3:0:0_2:1:0_7f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 299 40 70M * 0 0 TGCTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTACCAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0G30A37G0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_300_841_2:0:0_0:0:0_283/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 300 42 70M * 0 0 GGTTTTTATTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1C5T62 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_301_636_2:0:0_2:0:0_bb/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 301 42 70M * 0 0 CTTTTTTTACGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTCCATCAGTGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T50A10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_304_786_0:0:0_1:1:0_29f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 304 42 70M * 0 0 TTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_305_858_2:0:0_1:0:0_271/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 305 42 70M * 0 0 TTTTTCGACCAAAGGTACCGCGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:17A2A49 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_306_835_1:0:0_0:0:0_18b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 306 42 70M * 0 0 TATTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1T68 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_307_893_1:0:0_0:0:0_27f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 307 42 70M * 0 0 TTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCTGTACATCAGTGGCAAATGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G19 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_310_833_3:0:0_2:0:0_6d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 310 40 70M * 0 0 CGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGATTGTTGCAGTTCGGCGGTACAACAGTGGCAAATGCAGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32G5A14T16 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_318_822_1:0:0_2:0:0_1e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 318 42 70M * 0 0 GGTAACGAGGTAACAACCAAGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19T50 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_318_827_1:0:0_0:0:0_30b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 318 42 70M * 0 0 GGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACCTCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44A25 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_319_814_3:0:0_0:0:0_355/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 319 40 70M * 0 0 GTAACGAGGTAAGAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCATACCGTTTTCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12C46G1A8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_320_889_1:0:0_1:0:0_306/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 320 42 70M * 0 0 TAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGAGGCAAATGCAGAACGTTTTCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_321_749_0:0:0_1:1:0_290/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 321 42 70M * 0 0 AACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_323_837_1:0:0_2:0:0_243/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 323 42 70M * 0 0 CGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGAGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T25 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_324_790_1:0:0_2:1:0_182/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 324 42 70M * 0 0 GAGGTAAGAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7C62 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_325_823_0:0:0_0:0:0_214/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 325 42 70M * 0 0 AGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_328_800_0:0:0_1:1:0_e1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 328 42 70M * 0 0 TAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_328_886_2:0:0_1:0:0_24f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 328 42 70M * 0 0 TAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATTCAGAACGTTTTGTGCGGGTTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47G11C10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_329_822_1:0:0_2:0:0_1e8/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 329 42 70M * 0 0 AACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATGAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35C34 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_332_834_2:0:0_0:0:0_cd/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 332 42 70M * 0 0 AACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGAACATCAGTGGCAAATGCAGAACGATTTCTGCGGGTTGCCGAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T23T18 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_336_867_0:0:0_0:0:0_22a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 336 42 70M * 0 0 ATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_336_859_2:0:0_4:0:0_390/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 336 42 70M * 0 0 ATGGGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCACATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C32A33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_338_814_0:0:0_1:0:0_2db/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 338 42 70M * 0 0 GCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_339_866_1:0:0_1:0:0_294/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 339 42 70M * 0 0 CGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCCGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A43 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_343_800_1:0:0_3:1:0_ea/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 343 42 70M * 0 0 TGTTGAAGTTCGGCGGTACAACAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:20T49 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_343_829_3:0:0_2:0:0_16d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 343 40 70M * 0 0 TGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCTTGTTGCGGATATTCTGGAAAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:48G0G5C14 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_27_413_1:0:0_1:0:0_1f2/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 344 42 70M * 0 0 GTTGAAGTTCGGCGGGACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T54 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_346_862_3:0:0_0:0:0_263/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 346 40 70M * 0 0 TGCAGTTCGGCGGTACATCATTGGGAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2A17G3C45 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_348_817_2:0:0_0:0:0_207/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 348 42 70M * 0 0 AAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGTTTGCCGATATTCTTGAAAGCAATG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:45G13G10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_350_780_1:0:0_2:1:0_255/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 350 42 70M * 0 0 GTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTATTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:34T35 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_351_764_1:0:0_1:1:0_5c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 351 42 70M * 0 0 TTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCGGATATTCTGGAAAGCAATGCCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_352_891_6:0:0_1:0:0_2bc/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 352 23 70M * 0 0 TCGGGGGTCCATCCGTTGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTAGCCGATATTCTGGAAAGCAATGGCAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:4C3A4A2G26T22C3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_353_846_3:0:0_0:0:0_a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 353 40 70M * 0 0 CGGCTGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTACTGCGGGTTGCCGCTATTCTGGAAAGCAATGCCAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4G28T13A22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_355_765_1:0:0_1:1:0_111/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 355 42 70M * 0 0 GCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAAGGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26C43 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_355_715_2:0:0_3:0:0_22c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 355 42 70M * 0 0 GCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTACTGCGGGTTGCCGCTATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31T13A24 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_359_905_0:0:0_1:0:0_176/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 359 42 70M * 0 0 TACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_359_926_0:0:0_2:0:0_18d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 359 42 70M * 0 0 TACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_360_895_1:0:0_0:0:0_e9/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 360 42 70M * 0 0 ACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:69C0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_361_936_1:0:0_3:0:0_2f0/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 361 42 70M * 0 0 CATCAGTGGCAACTGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12A57 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_364_776_1:0:0_2:1:0_138/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 364 42 70M * 0 0 CAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGTCAGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64G5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_367_801_1:0:0_2:1:0_1d9/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 367 42 70M * 0 0 TGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGCAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42A27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_369_908_0:0:0_0:0:0_9/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 369 42 70M * 0 0 GCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_371_880_2:0:0_1:0:0_185/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 371 42 70M * 0 0 AAATGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATACTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T34C1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_374_882_1:0:0_1:0:0_178/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 374 42 70M * 0 0 AGCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:0T69 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_375_926_0:0:0_1:0:0_9b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 375 42 70M * 0 0 GCAGAACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_376_883_2:0:0_0:0:0_26f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 376 42 70M * 0 0 CAGAACGTATTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGTGGCAGGTGGCCACCGTCCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T41G19 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_377_823_1:0:0_0:0:0_2d4/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 377 42 70M * 0 0 AGAAGGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:4C65 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_380_860_0:0:0_1:0:0_dc/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 380 42 70M * 0 0 ACGTTTTCTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_387_883_0:0:0_2:0:0_2c5/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 387 42 70M * 0 0 CTGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_388_857_1:0:0_2:0:0_8/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 388 42 70M * 0 0 TGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCGAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C38 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_388_915_0:0:0_0:0:0_55/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 388 42 70M * 0 0 TGCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_389_934_0:0:0_1:0:0_288/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 389 42 70M * 0 0 GCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_389_886_1:0:0_2:0:0_393/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 389 42 70M * 0 0 GCGGGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCATGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32G37 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_391_857_1:0:0_1:0:0_379/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 391 42 70M * 0 0 GGGTTGCCGATATACTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13T56 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_392_834_0:0:0_4:0:0_1c7/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 392 42 70M * 0 0 GGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_395_942_0:0:0_0:0:0_6a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 395 42 70M * 0 0 TGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_397_897_0:0:0_0:0:0_103/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 397 42 70M * 0 0 CCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_75_466_1:0:0_1:0:0_4c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 397 42 70M * 0 0 CCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTCCCCCCGCCAAAATCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:53G16 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_398_983_0:0:0_2:0:0_29e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 398 42 70M * 0 0 CGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_401_885_1:0:0_1:0:0_149/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 401 42 70M * 0 0 TATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCCCCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A32 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_406_947_0:0:0_2:0:0_21/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 406 42 70M * 0 0 TGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_406_944_6:0:0_1:0:0_29b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 406 23 70M * 0 0 TGGAAAGGAATGCCAGGCCGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCTCCAAAAACACCAACGATGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-18 XN:i:0 XM:i:6 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:6 MD:Z:7C10A31G6T7C2C1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_407_984_2:0:0_1:0:0_7c/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 407 42 70M * 0 0 GGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCGTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCCTCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37C27A4 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_31_476_0:0:0_0:0:0_1/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 407 42 70M * 0 0 GGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_412_831_0:0:0_2:0:0_270/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 412 42 70M * 0 0 GCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_412_965_1:0:0_0:0:0_2a4/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 412 42 70M * 0 0 GCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGGCAAAATCACCAACCATCTGGTAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45C24 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_413_973_1:0:0_2:0:0_68/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 413 42 70M * 0 0 CAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACGGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C42 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_416_889_2:0:0_2:0:0_122/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 416 42 70M * 0 0 TGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCTTCCTCTCTGCCCCCGCCCAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25G17A26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_418_952_1:0:0_1:0:0_0/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 418 42 70M * 0 0 CCAGGCAGTGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8G61 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_420_938_0:0:0_0:0:0_174/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 420 42 70M * 0 0 AGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_421_948_3:0:0_0:0:0_3e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 421 40 70M * 0 0 GGCAGGGGCATGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCAGCAACCATCTGGTAGCGATTATTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10G34C18G5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_422_991_2:0:0_1:0:0_142/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 422 42 70M * 0 0 GCATGTGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3G1G64 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_423_963_1:0:0_0:0:0_1b6/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 423 42 70M * 0 0 CCGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1A68 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_423_872_2:0:0_2:0:0_3e0/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 423 42 70M * 0 0 CAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGGCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTTAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28C37G3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_424_983_0:0:0_1:0:0_1f7/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 424 42 70M * 0 0 AGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_428_927_3:0:0_1:0:0_26/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 428 40 70M * 0 0 GCAGGTGGCGACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCCTCTGGTAGCGATGATTGAAAAAAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C34A23C1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_428_948_1:0:0_0:0:0_167/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 428 42 70M * 0 0 GCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCCCCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:37A32 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_428_958_1:0:0_1:0:0_344/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 428 42 70M * 0 0 GCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACGATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43C26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_431_934_2:0:0_1:0:0_304/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 431 42 70M * 0 0 GGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCGCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGGGATGATTGAAAAAACCATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:23C26C19 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_434_961_1:0:0_3:0:0_f1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 434 42 70M * 0 0 GGCCACCGTCCACTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11T58 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_78_506_1:0:0_0:0:0_2b6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 437 42 70M * 0 0 CACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_438_870_3:0:0_1:0:0_b3/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 438 40 70M * 0 0 ACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAAACACCAACCATCTGGTAGCTATGATTGAAAAAACCATTATCGGTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:25T18G19G5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_441_917_2:0:0_0:0:0_226/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 441 42 70M * 0 0 GTCCTCTCTTCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTGAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9G56C3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_443_969_1:0:0_1:0:0_ca/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 443 42 70M * 0 0 CCTGTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:3C66 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_57_513_1:0:0_3:0:0_3e5/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 444 40 70M * 0 0 CTCTCTGCCCACGCCAAAATAACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:10C9C48G0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_445_956_2:0:0_2:0:0_1c8/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 445 42 70M * 0 0 TCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCATCAGGTAGCGATGATAGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T12T26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_445_996_1:0:0_1:0:0_253/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 445 42 70M * 0 0 TCTCTGCCCCCGGCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12C57 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_446_990_2:0:0_1:0:0_e2/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 446 42 70M * 0 0 CTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAAGCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCCTTAGCGGTCAGGATGCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24C27A17 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_455_962_1:0:0_1:0:0_333/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 455 42 70M * 0 0 CGCCAAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGTTCAGGATGCTTTACCCAAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50G19 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_456_951_1:0:0_1:0:0_127/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 456 42 70M * 0 0 GCCAAAATCACCACCCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13A56 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_16_526_3:0:0_1:0:0_be/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 457 42 70M * 0 0 CCAAAATCACCAACCATCTCGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:19G50 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_459_952_1:0:0_1:0:0_104/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 459 42 70M * 0 0 AAAATCACCAACCATCTTGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:17G52 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_15_528_2:0:0_1:0:0_13c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 459 42 70M * 0 0 AAAATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGGCAGGATGCTTTACCCAATATCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47T22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_461_882_3:0:0_0:0:0_147/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 461 40 70M * 0 0 AATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAACCCCTTAGCGGTCAGGATGCTTTACCGAATATCAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34A2A22C9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_462_967_0:0:0_2:0:0_1cb/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 462 42 70M * 0 0 ATCACCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_5_532_3:0:0_1:0:0_156/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 463 42 70M * 0 0 TCACCATCCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6A63 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_57_535_3:0:0_1:0:0_1f0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 466 42 70M * 0 0 CCAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCTATATCAGCGATGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:56A13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_104_536_3:0:0_3:0:0_188/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 467 40 70M * 0 0 CAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGCTCAGGATGCTTTACCCAATATCTGCGATCCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:38G22A5G2 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_14_536_0:0:0_0:0:0_244/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 467 42 70M * 0 0 CAACCATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_471_981_0:0:0_3:0:0_23d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 471 42 70M * 0 0 CATCTGGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_476_967_2:0:0_1:0:0_267/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 476 42 70M * 0 0 GGTAGCGATGATTGAAAAAACGATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGAATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21C44T3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_65_545_2:0:0_1:0:0_14e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 476 42 70M * 0 0 GGTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCATTATCAGCGATGCCGAACGTATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47A22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_477_943_1:0:0_3:0:0_14f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 477 42 70M * 0 0 GTAGCGATGATTGAAACAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A53 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_477_930_0:0:0_2:0:0_341/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 477 42 70M * 0 0 GTAGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_481_917_3:0:0_1:0:0_34a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 481 40 70M * 0 0 CGATGATTGCAAAAACCAATAGCTGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A8T4G46 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_78_550_0:0:0_1:0:0_112/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 481 42 70M * 0 0 CGATGATTGTAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:9A60 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_71_550_2:0:0_1:0:0_16a/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 481 42 70M * 0 0 CGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCAGAACGTATTTTTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55C14 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_486_993_3:0:0_3:0:0_1f1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 486 40 70M * 0 0 ATTGAAACAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGAATATTTGCCGAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7A48T2T10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_487_909_1:0:0_2:0:0_80/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 487 42 70M * 0 0 TTGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCCATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A34 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_92_557_3:0:0_0:0:0_1b8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 488 42 70M * 0 0 TGAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_489_982_0:0:0_1:0:0_54/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 489 42 70M * 0 0 GAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_64_558_1:0:0_2:0:0_100/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 489 42 70M * 0 0 GAAAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTAACCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTGTGCCGAACTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30C27T11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_491_997_0:0:0_1:0:0_1fa/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 491 42 70M * 0 0 AAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_116_560_1:0:0_1:0:0_2c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 491 42 70M * 0 0 AAAAACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTTTTTTTGCCGAACTTCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52A17 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_494_935_0:0:0_1:0:0_3ad/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 494 42 70M * 0 0 AACCATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_497_947_0:0:0_2:0:0_14b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 497 42 70M * 0 0 CATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_7_566_0:0:0_1:0:0_10d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 497 42 70M * 0 0 CATTAGCGGTCAGGAGGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15T54 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_76_566_1:0:0_1:0:0_312/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 497 42 70M * 0 0 CATTAGCGGTCAGGATGCTTTACCCTATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A44 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_93_570_2:0:0_0:0:0_a7/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 501 42 70M * 0 0 AGCGGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_504_924_1:0:0_3:0:0_21b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 504 42 70M * 0 0 GGTCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGCCGGGACTCGCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57A12 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_26_575_0:0:0_2:0:0_24d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 506 42 70M * 0 0 TCAGGATGCTTGACCCAATATCAGCGATGACGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11T17C40 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_508_977_1:0:0_4:0:0_1c5/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 508 42 70M * 0 0 AGGATGCTTTAGCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:11C58 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_509_970_0:0:0_3:0:0_34d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 509 42 70M * 0 0 GGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_117_582_2:0:0_1:0:0_25/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 513 42 70M * 0 0 GCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATGTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:32T37 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_133_582_1:0:0_0:0:0_2e5/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 513 42 70M * 0 0 GCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_39_582_3:0:0_2:0:0_2f8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 513 42 70M * 0 0 GCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACCGATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28G0T40 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_77_583_2:0:0_1:0:0_35e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 514 42 70M * 0 0 CTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGACGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_33_585_4:0:0_1:0:0_17b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 516 42 70M * 0 0 TTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGACGCCCAGCCGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:58C11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_113_593_2:0:0_2:0:0_118/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 524 42 70M * 0 0 TATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCACCCGGGTTTTCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:57G5A6 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_53_593_2:0:0_3:0:0_177/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 524 40 70M * 0 0 TATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCAGCCAACCCGGGATTTCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:51C3C1G12 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_51_593_0:0:0_4:0:0_1d7/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 524 40 70M * 0 0 TTTCTGCGATGCCGAACGTATGTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTGCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:1A2A16T44T3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_529_996_1:0:0_2:0:0_38f/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 529 42 70M * 0 0 GCTATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2G67 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_65_598_2:0:0_1:0:0_f8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 529 42 70M * 0 0 GCGATGCCGAACCTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:12G57 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_163_599_1:0:0_0:0:0_155/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 530 42 70M * 0 0 CGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_65_601_1:0:0_0:0:0_73/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 532 42 70M * 0 0 ATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_191_601_0:0:0_1:0:0_2c2/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 532 42 70M * 0 0 ATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68C1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_62_605_0:0:0_2:0:0_1a2/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 536 42 70M * 0 0 CGAACCTAGTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:5G2T61 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_537_958_2:0:0_2:0:0_8a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 537 42 70M * 0 0 GAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGTGATTTCCGCTGGCACAATTTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:48G19G1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_72_606_1:0:0_0:0:0_38/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 537 42 70M * 0 0 GAACGTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_121_610_0:0:0_0:0:0_5f/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 541 42 70M * 0 0 GTATTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_105_613_2:0:0_2:0:0_282/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 544 42 70M * 0 0 TTTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGACGGGATTTCCGCTGCCACAATTGAAAACTTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:38C14G16 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_141_614_1:0:0_0:0:0_5e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 545 42 70M * 0 0 TTTTGCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_75_616_1:0:0_1:0:0_2c9/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 547 42 70M * 0 0 TTGCCGAACTTCTGTCGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14A55 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_41_616_0:0:0_2:0:0_365/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 547 42 70M * 0 0 TTGCCGAACTTATGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C56G1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_87_618_3:0:0_2:0:0_40/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 549 42 70M * 0 0 GCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCAGCCCAGACGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26C6C36 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_69_618_2:0:0_0:0:0_139/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 549 42 70M * 0 0 GCCGAACTTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_550_950_2:0:0_2:0:0_236/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 550 42 70M * 0 0 CCGAACTTCTTACGGGACTCGCCTCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:10G12G46 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_48_625_1:0:0_2:0:0_2ea/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 556 42 70M * 0 0 TTCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATGTCCGCTGGCACAATGGAAAACTTTCGTCGACCAGGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:33T14T21 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_4_626_0:0:0_0:0:0_c3/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 557 42 70M * 0 0 TCTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_126_626_0:0:0_1:0:0_1e4/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 557 42 70M * 0 0 TCTGACGGGACTCGACGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:14C55 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_58_628_0:0:0_1:0:0_281/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 559 42 70M * 0 0 TGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACATTTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43A26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_136_628_2:0:0_1:0:0_380/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 559 42 70M * 0 0 TGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCAAAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:41C28 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_132_630_1:0:0_1:0:0_169/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 561 42 70M * 0 0 ACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGTATTTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64A5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_159_630_3:0:0_1:0:0_3a5/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 561 42 70M * 0 0 ACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGCATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25G44 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_176_631_1:0:0_0:0:0_90/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 562 42 70M * 0 0 CGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_163_634_1:0:0_1:0:0_69/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 565 42 70M * 0 0 GACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAAGTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_153_635_3:0:0_1:0:0_191/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 566 42 70M * 0 0 ACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACTATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A34 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_166_636_4:0:0_2:0:0_29a/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 567 42 70M * 0 0 CTCGCCGCCGCCCAGCCGGGTTTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATGTGCCCAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20A40T8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_56_639_2:0:0_2:0:0_63/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 570 42 70M * 0 0 GCCGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTGTCGTCGACCAGGAATTTCCCCAAATAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42T17G9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_571_997_4:0:0_2:0:0_4e/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 571 40 70M * 0 0 CCGCCGCCCAGCGGGGCTTACCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAAAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:12C3A2T46T3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_81_641_3:0:0_1:0:0_285/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 572 42 70M * 0 0 CGCCGACCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5C64 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_165_641_2:0:0_0:0:0_3dc/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 572 42 70M * 0 0 CGCCGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_214_644_3:0:0_1:0:0_224/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 575 42 70M * 0 0 CGCCCAGCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCATATAAAACAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60A9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_163_650_3:0:0_2:0:0_1ec/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 581 42 70M * 0 0 GCCGGGATTTCCCCTGGAACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12G4C52 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_80_650_0:0:0_1:0:0_302/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 581 42 70M * 0 0 GCCGGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGAACAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:39C30 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_79_651_2:0:0_4:0:0_134/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 582 40 70M * 0 0 CCGCGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATATTAAATGTCCTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3G53A0A1C9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_173_653_0:0:0_1:0:0_2e8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 584 42 70M * 0 0 GGGATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACGTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27T42 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_54_655_2:0:0_0:0:0_38a/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 586 42 70M * 0 0 GATTTCCGCTGGCACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_49_661_2:0:0_3:0:0_109/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 592 40 70M * 0 0 CGCTGGAACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAATACATGTCCTGCATGCCATCAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6C41A14G6 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_158_662_2:0:0_2:0:0_3c8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 593 42 70M * 0 0 GCTGGCACATTTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGAATCAGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A53C6 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_119_663_2:0:0_3:0:0_17/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 594 40 70M * 0 0 CTGGCACAATTCAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCGGCATGGCAGCAGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11G43T8T5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_142_667_1:0:0_2:0:0_af/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 598 42 70M * 0 0 CACAATTGAAAACTTTCGTCGACCTGGAATTTGCCCAAAGAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:24A14T30 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_188_667_0:0:0_0:0:0_14c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 598 42 70M * 0 0 CACAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_149_669_4:0:0_1:0:0_367/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 600 42 70M * 0 0 CAATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGTATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:25A44 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_126_671_2:0:0_1:0:0_20/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 602 42 70M * 0 0 ATTGAAAACTTTCGTCGAACAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:18C51 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_105_671_1:0:0_0:0:0_297/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 602 42 70M * 0 0 ATTGAAAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_202_672_1:0:0_3:0:0_26c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 603 40 70M * 0 0 TTGAAAACGTTCGTAGACAAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:8T5C3C51 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_170_676_4:0:0_2:0:0_f9/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 607 42 70M * 0 0 AAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATTAAACTTGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A4A33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_180_676_4:0:0_0:0:0_11e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 607 42 70M * 0 0 AAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_119_676_5:0:0_0:0:0_34f/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 607 42 70M * 0 0 AAACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_102_678_0:0:0_0:0:0_b1/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 609 42 70M * 0 0 ACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_213_678_1:0:0_0:0:0_3c0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 609 42 70M * 0 0 ACTTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_209_680_1:0:0_0:0:0_a8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 611 42 70M * 0 0 TTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_310_680_0:0:0_0:0:0_303/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 611 42 70M * 0 0 TTTCGTCGACCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_246_682_0:0:0_1:0:0_220/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 613 42 70M * 0 0 TCGTCGACCAGGATTTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:13A56 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_250_686_4:0:0_3:0:0_125/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 617 40 70M * 0 0 CGACCAGGAATGTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGACCGGTTAGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:11T48C4A4 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_226_687_0:0:0_1:0:0_49/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 618 42 70M * 0 0 GACCAGGTATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A62 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_258_692_1:0:0_0:0:0_1a4/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 623 42 70M * 0 0 GGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_213_693_1:0:0_0:0:0_289/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 624 42 70M * 0 0 GAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_157_695_0:0:0_0:0:0_4b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 626 42 70M * 0 0 ATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_195_698_3:0:0_2:0:0_d4/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 629 42 70M * 0 0 TGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTCTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCGGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:36G29T3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_186_698_0:0:0_1:0:0_1df/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 629 42 70M * 0 0 TGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGCGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40G29 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_214_698_3:0:0_1:0:0_3b7/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 629 42 70M * 0 0 TGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATAAACGCTGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_220_699_1:0:0_1:0:0_9e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 630 42 70M * 0 0 GCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGAAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42C27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_160_701_1:0:0_3:0:0_218/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 632 40 70M * 0 0 CCAAATAAAACAGGTCCTGCATGGCATCAGGTTCTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12T17T2G36 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_149_702_3:0:0_3:0:0_131/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 633 40 70M * 0 0 CAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCACTGCCCGGAGAGCATAAACGCTGCGCTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:41G8T5C13 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_251_703_0:0:0_3:0:0_1e9/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 634 40 70M * 0 0 AAATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCAGGATTGCATCAACGCTGCCCTGAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:45C4A13G5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_230_704_2:0:0_0:0:0_201/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 635 42 70M * 0 0 AATAAAACATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_249_708_2:0:0_1:0:0_30/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 639 42 70M * 0 0 AAACATGTCCTGCATGCCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16G53 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_171_709_2:0:0_2:0:0_3df/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 640 42 70M * 0 0 AACATGTCCTGAATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGTTTTGCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C50A7 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_255_711_4:0:0_2:0:0_41/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 642 42 70M * 0 0 CATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCACTGCCCGGAGAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32G8T28 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_311_711_1:0:0_1:0:0_29c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 642 42 70M * 0 0 CATGTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTCATTTGCCGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59G10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_196_714_0:0:0_2:0:0_15/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 645 42 70M * 0 0 GTCCTGCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCCGATAGCATCAACGCTCCGCTGATTTGCCGTGGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35G15G18 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_227_719_2:0:0_0:0:0_3f/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 650 42 70M * 0 0 GCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_196_719_1:0:0_0:0:0_184/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 650 42 70M * 0 0 GCATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_123_720_0:0:0_0:0:0_1a1/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 651 42 70M * 0 0 CATGGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_220_723_2:0:0_0:0:0_24/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 654 42 70M * 0 0 GGCATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_198_725_2:0:0_0:0:0_3bd/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 656 42 70M * 0 0 CATCAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_225_730_2:0:0_3:0:0_39/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 661 40 70M * 0 0 GTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCATCGCTGCGCTGATTTGCAGTGGCGAGATAATGTCGATCGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:30A16C9A12 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_255_731_2:0:0_1:0:0_4a/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 662 42 70M * 0 0 TTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATAAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:27C42 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_180_733_1:0:0_0:0:0_279/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 664 42 70M * 0 0 TGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_225_736_1:0:0_1:1:0_66/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 667 42 70M * 0 0 TGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATCTCGATCGCCATTAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:55G13T0 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_257_737_0:0:0_2:1:0_386/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 668 40 70M * 0 0 GGGGCAGTGCCCCGATAGCAGCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:12G7T47T1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_144_739_1:0:0_1:1:0_d6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 670 42 70M * 0 0 GGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGGCGATCGCCATTAGGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:53T12T3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_243_740_1:0:0_2:1:0_6e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 671 40 70M * 0 0 GCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTGGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATAGCCATTAGGGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:34T22C7T4 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_337_741_1:0:0_0:1:0_ad/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 672 42 70M * 0 0 CAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_196_741_1:0:0_1:1:0_35f/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 672 42 70M * 0 0 CAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCCAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:42G21T5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_216_744_4:0:0_2:1:0_257/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 675 40 70M * 0 0 GGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGGCGATCGCCATTAGGGCCGGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0T47T12T8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_270_744_2:0:0_0:1:0_28f/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 675 42 70M * 0 0 TGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61T8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_236_746_1:0:0_1:1:0_3af/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 677 42 70M * 0 0 CCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATGTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:27T31T10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_292_747_1:0:0_1:1:0_1b3/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 678 42 70M * 0 0 CCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCCTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31G26T11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_252_748_1:0:0_0:1:0_258/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 679 42 70M * 0 0 CGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:57T12 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_197_750_2:0:0_2:1:0_275/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 681 42 70M * 0 0 GATAGCATCAACGCTGCGCTCATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTACGGCCGGCGTGTTAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G34T14 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_238_750_2:0:0_0:1:0_3ca/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 681 42 70M * 0 0 GATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:55T14 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_180_751_1:0:0_1:1:0_21d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 682 42 70M * 0 0 ATAGCATCAACGCTGCGCTGAGTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:21T32T15 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_266_755_1:0:0_1:1:0_1ba/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 686 42 70M * 0 0 CATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTACGGCCGGCGTGTTAGAAGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:50T19 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_235_757_0:0:0_1:1:0_141/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 688 42 70M * 0 0 TCAACGCTGCGCTGTTTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:14A33T21 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_239_759_1:0:0_2:1:0_3/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 690 40 70M * 0 0 AACGCGGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCCTGTTAGAAGCGCGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T40T7G15 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_183_760_3:0:0_1:1:0_e7/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 691 42 70M * 0 0 ACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGTAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:26A18T24 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_253_761_1:0:0_0:1:0_17c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 692 42 70M * 0 0 CGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:44T25 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_186_761_1:0:0_1:1:0_19e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 692 42 70M * 0 0 CGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGTAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25A18T25 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_269_762_1:0:0_2:1:0_2a6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 693 40 70M * 0 0 GCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTAGATCGACATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:31C5C5T26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_326_762_0:0:0_2:1:0_2f1/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 693 40 70M * 0 0 GCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCCCCATTAGGGACGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:36G6T2C23 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_247_766_1:0:0_1:1:0_1e0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 697 42 70M * 0 0 CGCTGATTTGCCGTGGCGAGAATATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22A16T30 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_283_767_2:0:0_2:1:0_32c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 698 40 70M * 0 0 GCTGATTTGCCGTGGCGAGAATATGTCGATCGCCATTAGCGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:21A16T0G30 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_251_769_0:0:0_0:1:0_223/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 700 42 70M * 0 0 TGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36T33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_253_769_3:0:0_3:1:0_31a/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 700 40 70M * 0 0 TGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATGAGGGCCGGCGTCTGAGAAGCGCGTGGTCACAACGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:34T1T9G1T21 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_228_773_2:0:0_1:1:0_2fb/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 704 42 70M * 0 0 TTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:32T35C1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_207_775_2:0:0_3:1:0_aa/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 706 40 70M * 0 0 CCCGTGGCGAGAAAAGGTCGATAGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:0G14T6C7T39 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_324_775_4:0:0_0:1:0_1b1/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 706 42 70M * 0 0 GCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30T39 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_320_777_2:0:0_2:1:0_e6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 708 40 70M * 0 0 CGTGGCGAGTAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACCTTACCGTTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9A18T31G9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_320_780_3:0:0_1:1:0_216/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 711 42 70M * 0 0 GGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCCTGGTCACAACGTTACCGTTATCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25T20G23 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_215_784_2:0:0_0:1:0_3c5/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 715 42 70M * 0 0 AGAAAATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:21T48 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_339_789_0:0:0_3:1:0_cf/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 720 40 70M * 0 0 ATGTCGATAGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTAACAACGTTACCGTTAGCGATCCGGTCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:8C7T25C15T11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_260_789_1:0:0_1:1:0_ef/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 720 42 70M * 0 0 ATGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCAGGTCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16T47C5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_349_790_2:0:0_1:1:0_3d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 721 42 70M * 0 0 TGTCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGGTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:15T10T43 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_267_792_3:0:0_1:1:0_316/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 723 42 70M * 0 0 TCGATCGCCATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTCGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13T22G33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_228_795_2:0:0_2:1:0_bc/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 726 40 70M * 0 0 ATCGCCAGTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCCTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:7T2T20G38 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_290_800_2:0:0_2:1:0_1be/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 731 40 70M * 0 0 CATTAGGGCCGGCGTGTGAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAATACTGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T11T44A7 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_236_800_1:0:0_0:1:0_2f2/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 731 42 70M * 0 0 CATTAGGGCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:5T64 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_243_803_1:0:0_2:1:0_2b0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 734 40 70M * 0 0 TAGGGCCGGCGTGTTAGATGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGATAAACTGCTGGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:2T15A38A12 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_277_806_3:0:0_4:0:0_179/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 737 40 70M * 0 0 GGCCGGCGTGTTAGAAGAGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGATATTCTGCTGGCAGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:17C36A1A0A12 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_268_807_4:0:0_0:0:0_2c3/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 738 42 70M * 0 0 GCCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_289_808_0:0:0_2:0:0_190/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 739 42 70M * 0 0 CCGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCAAAACGTTACCGTTATAGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:25C14C29 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_348_809_1:0:0_2:0:0_8f/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 740 42 70M * 0 0 CGGCGTGTTAGAAGCGCGTCGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAAATGCTGGCAGTGGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:19G35C14 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_298_809_3:0:0_3:0:0_b6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 740 40 70M * 0 0 CGGCGTGTTAGAAGCGCGGCGTCACAACCTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18T0G8G41 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_296_809_0:0:0_2:0:0_120/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 740 42 70M * 0 0 CGGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGTTCCGGTCGAAAAAATGCTGGCAGTGGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41A13C14 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_293_810_0:0:0_3:0:0_98/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 741 40 70M * 0 0 GGCGTGTTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAAATCCTGGAAGTGGGTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:54C1G4C8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_337_811_0:0:0_2:0:0_36c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 742 42 70M * 0 0 CCGTGTTAGTAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G8A60 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_303_814_3:0:0_2:0:0_65/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 745 42 70M * 0 0 TGTTAGAAGCGAGGGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:11C1T56 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_341_816_0:0:0_1:0:0_46/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 747 42 70M * 0 0 TTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCGGGCAGTGGGTCATTACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:52T17 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_291_816_0:0:0_2:0:0_1c3/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 747 42 70M * 0 0 TTAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGCTCGAAAATCTGCTGGCAGTGGGTCATTACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:39G7A22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_329_816_0:0:0_3:0:0_292/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 747 40 70M * 0 0 TTAGAAGCGCGTGGTCACAAAGTTACCGTGATCGAGCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20C8T5T34 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_327_817_1:0:0_0:0:0_37b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 748 42 70M * 0 0 TAGAAGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_291_821_1:0:0_0:0:0_3b5/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 752 42 70M * 0 0 AGCGCGTGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_369_824_1:0:0_1:0:0_2b2/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 755 42 70M * 0 0 GCGTGGGCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6T63 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_395_827_0:0:0_2:0:0_64/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 758 42 70M * 0 0 TGGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGATGGCAGTGGGTCATTACCTCGATTCTACC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40C22A6 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_311_828_1:0:0_0:0:0_12d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 759 42 70M * 0 0 GGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_271_828_2:0:0_2:0:0_26e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 759 42 70M * 0 0 GGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTCCGTCATTACCTCGAATCTACCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:47G0G21 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_355_828_1:0:0_1:0:0_2a8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 759 42 70M * 0 0 GGTCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAAATGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36C33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_360_829_3:0:0_2:0:0_325/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 760 42 70M * 0 0 GGCACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAAATGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1T33C34 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_397_832_2:0:0_2:0:0_2d5/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 763 42 70M * 0 0 ACAACGTGACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTCGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:7T35G26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_363_832_2:0:0_0:0:0_381/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 763 42 70M * 0 0 ACAACGTTACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_471_835_1:0:0_1:0:0_de/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 766 42 70M * 0 0 ACGTTACCGTTATCGATCCGGTCCAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23G46 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_399_836_2:0:0_1:0:0_347/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 767 42 70M * 0 0 CGTTACCGGTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:8T61 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_299_837_1:0:0_1:0:0_1d3/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 768 42 70M * 0 0 GTTACCCTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:6G63 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_366_839_1:0:0_2:0:0_12/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 770 42 70M * 0 0 TACCGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTAATTACCTCGAATCTACCGTTCATATTGCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40C20G8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_330_843_1:0:0_2:0:0_5/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 774 42 70M * 0 0 GTTATCGATCCGGTCGTAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGATGAAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:16A47C5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_305_843_0:0:0_1:0:0_308/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 774 42 70M * 0 0 GTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTTCCGTTGATATTGCTGAAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:51A18 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_373_845_1:0:0_4:0:0_3aa/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 776 40 70M * 0 0 TATAGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTAATTACCTCGAATCTACCGTTGTTATTGCTGTATCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:3C30C21A8A4 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_395_847_2:0:0_0:0:0_14d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 778 42 70M * 0 0 TCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_362_850_1:0:0_3:0:0_113/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 781 40 70M * 0 0 ATCCGGTCGAAAAACTGCGGGCTGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCGGAATCCACCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18T3A35T11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_412_854_0:0:0_0:0:0_37/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 785 42 70M * 0 0 GGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_298_858_3:0:0_3:0:0_79/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 789 40 70M * 0 0 GAAAAACTGCTGGCTGTGGGTCATTACATCGAATCTACCGTTGATATTGCTGATTCCACCCGCCGTATTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:14A12C25A16 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_299_858_0:0:0_0:0:0_8e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 789 42 70M * 0 0 GAAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_340_859_3:0:0_2:0:0_3d3/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 790 42 70M * 0 0 AAAAACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCTCGATTCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGACGTATTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31A29C8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_415_862_0:0:0_1:0:0_d8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 793 42 70M * 0 0 AACTGCTGGCAGTGGGTCATTACCGCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T45 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_361_865_3:0:0_1:0:0_121/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 796 42 70M * 0 0 TGCTGGCAGTGGGTCATTACCTAGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22C47 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_392_870_1:0:0_1:0:0_2b7/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 801 42 70M * 0 0 GCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTTCCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24A45 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_304_870_1:0:0_1:0:0_331/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 801 42 70M * 0 0 GCAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACACGCCGTATTGCGGCAAGCCGCA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47C22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_421_871_2:0:0_1:0:0_1cc/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 802 42 70M * 0 0 CAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGATTCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:40A29 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_356_871_0:0:0_0:0:0_2f6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 802 42 70M * 0 0 CAGTGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_392_873_0:0:0_3:0:0_242/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 804 40 70M * 0 0 GTGGGTCATTACCTCGAATCTACAGTTGATATTGCTCAATCCAACCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:23C12G6C26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_401_874_0:0:0_2:0:0_ac/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 805 42 70M * 0 0 TGGGTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGACGCAGTCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61C4T3 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_457_877_2:0:0_1:0:0_fb/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 808 42 70M * 0 0 GTCATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:68G1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_303_879_1:0:0_1:0:0_c6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 810 42 70M * 0 0 CATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGAATTCCGGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:59C10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_386_879_2:0:0_0:0:0_1d0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 810 42 70M * 0 0 CATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_386_880_4:0:0_1:0:0_2e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 811 42 70M * 0 0 ATTACCTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTCCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:47G22 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_388_881_1:0:0_3:0:0_3a0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 812 40 70M * 0 0 TTACCGCGAATCTACCGTTGATTTTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATGCCGGCTGAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5T16A37T9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_441_884_3:0:0_2:0:0_36b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 815 42 70M * 0 0 CCTCGAATCTACCGTTGATAGTGCTGAATCCACCCCCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20T14G34 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_420_885_0:0:0_1:0:0_193/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 816 42 70M * 0 0 CTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCAACCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:31C38 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_452_885_1:0:0_0:0:0_319/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 816 42 70M * 0 0 CTCGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_388_886_2:0:0_1:0:0_2d8/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 817 42 70M * 0 0 TAGAATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:1C68 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_350_886_3:0:0_1:0:0_2e2/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 817 42 70M * 0 0 TCGAATCTACCGTTGATATTGCTGTATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACAT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24A45 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_442_890_0:0:0_1:0:0_340/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 821 42 70M * 0 0 ATCTACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCAGCATTCCGGCTGACCACATGGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:46C23 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_335_893_1:0:0_2:0:0_19d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 824 42 70M * 0 0 TACCGTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGGATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGGGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:30T34T4 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_407_896_2:0:0_4:0:0_165/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 827 40 70M * 0 0 CGTTGATATTGCTGTTTCCACCCGCCCTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGAACACATGGTGCTGATG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:14A0A10G27C15 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_401_897_0:0:0_2:0:0_33/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 828 42 70M * 0 0 GTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTAGTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTCCTGATGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28T33G7 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_420_897_1:0:0_1:0:0_2eb/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 828 42 70M * 0 0 GTTGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCGGATGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:64T5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_441_898_1:0:0_2:0:0_23e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 829 42 70M * 0 0 TTGATATTGCTGTATCCACCCGCCGTATTGAGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:12A17C39 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_425_899_0:0:0_0:0:0_3c2/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 830 42 70M * 0 0 TGATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_490_900_0:0:0_0:0:0_192/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 831 42 70M * 0 0 GATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_435_900_2:0:0_1:0:0_3d6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 831 42 70M * 0 0 GATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCGGATGGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:61T8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_401_901_2:0:0_1:0:0_305/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 832 42 70M * 0 0 ATATTGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCTTTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38A31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_307_905_1:0:0_3:0:0_c4/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 836 40 70M * 0 0 TGCTGAATCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCCCATTCCGGCTGTCCACATGGTGCTGATGCCTGGTTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:32G11A16G8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_387_905_0:0:0_4:0:0_f0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 836 40 70M * 0 0 TGCTGAATCCACCCGCCGTAGTGCGGCAACCCGCTTTCAGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-12 XN:i:0 XM:i:4 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:4 MD:Z:20T8G4A3C31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_397_909_0:0:0_2:0:0_227/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 840 42 70M * 0 0 GAATCCACCCGCCGTATTCCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18G49T1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_450_913_2:0:0_0:0:0_c9/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 844 42 70M * 0 0 CCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_439_913_3:0:0_0:0:0_2e0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 844 42 70M * 0 0 CCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_488_915_0:0:0_1:0:0_b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 846 42 70M * 0 0 ACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGCTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:42G27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_344_915_0:0:0_2:0:0_153/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 846 42 70M * 0 0 ACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATCGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:41G26T1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_354_919_1:0:0_1:0:0_3bc/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 850 42 70M * 0 0 GCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGACGGTAATGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60C9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_423_922_1:0:0_1:0:0_29/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 853 42 70M * 0 0 GTATTGCGGCAAGCCGCATTCCCGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22G47 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_436_928_2:0:0_1:0:0_53/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 859 42 70M * 0 0 CGGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGTTGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:35A34 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_482_928_1:0:0_2:0:0_7e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 859 42 70M * 0 0 CGGCAAGCCGCATTCCGGCTGAACACATGGTGCTGATGGCTGGGTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:22C20T26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_363_929_2:0:0_0:0:0_18a/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 860 42 70M * 0 0 GGCAAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_356_931_0:0:0_2:0:0_2e1/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 862 42 70M * 0 0 CAAGCCGCAGTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTAACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9T33C26 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_465_932_2:0:0_0:0:0_9f/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 863 42 70M * 0 0 AAGCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_430_932_0:0:0_1:0:0_3e4/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 863 42 70M * 0 0 AAGCCGCATTCCGGCTGACCACTTGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:22A47 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_390_934_1:0:0_2:0:0_30d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 865 42 70M * 0 0 GCCGCATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTCGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTCGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:35G31G2 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_435_939_0:0:0_1:0:0_166/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 870 42 70M * 0 0 ATTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCTCTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:36A33 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_409_940_1:0:0_2:0:0_36/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 871 42 70M * 0 0 TTCCGGCTGTCCACATGGTGCTGATGGCTCGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:9A19G40 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_418_940_1:0:0_1:0:0_1a7/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 871 42 70M * 0 0 TTCCGGCTGACCACATGGTGCTGATGCCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26G43 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_438_942_1:0:0_2:0:0_326/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 873 42 70M * 0 0 CCGGCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGCTAATGAAAAAGGCGAGCTGGGGGTTCTGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:40G20T8 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_430_945_0:0:0_2:0:0_132/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 876 42 70M * 0 0 GCTGACCACATGGTGCTGATCGCTGGTTTAACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:20G8C40 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_452_945_1:0:0_3:0:0_35b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 876 40 70M * 0 0 GCTGACCACATGGTGCTGATGGCTGGTGTCACTGCCGCTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTATGGGAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:27T9G25C6 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_402_947_1:0:0_1:0:0_39e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 878 42 70M * 0 0 TGACCACATGGTGCTGTTGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:16A53 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_442_950_0:0:0_0:0:0_2af/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 881 42 70M * 0 0 CCACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_420_951_2:0:0_2:0:0_20a/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 882 42 70M * 0 0 CACATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGTAAAAGGCGAGCTGGTCGTTCTGGGACGCAACG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:37A15G16 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_489_953_1:0:0_2:0:0_27b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 884 42 70M * 0 0 CATGGTGCGGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACCCAACGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8T53G7 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_417_954_1:0:0_0:0:0_19b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 885 42 70M * 0 0 ATGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_451_955_1:0:0_1:0:0_10c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 886 42 70M * 0 0 TGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACCCAACGGTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:60G9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_413_955_0:0:0_3:0:0_2b9/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 886 40 70M * 0 0 TGGTGCTGATGGCTGGTTTCTCTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGCGACGCTACGGTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:20A35G5A7 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_402_955_1:0:0_0:0:0_2c6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 886 42 70M * 0 0 TGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_413_955_2:0:0_0:0:0_318/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 886 42 70M * 0 0 TGGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_486_956_2:0:0_2:0:0_d1/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 887 42 70M * 0 0 GGTGCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTTATGTAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:28A3A37 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_375_957_2:0:0_2:0:0_50/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 888 42 70M * 0 0 GTGCTGATCGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACCCAACGGTTCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G49G11 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_430_959_2:0:0_0:0:0_9a/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 890 42 70M * 0 0 GCTGATGGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_464_965_3:0:0_2:0:0_3b0/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 896 42 70M * 0 0 GGCTGGTTTCACTGCCGGGAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:18T49C1 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_397_965_1:0:0_0:0:0_3b9/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 896 42 70M * 0 0 GGCTGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_337_966_1:0:0_2:0:0_315/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 897 42 70M * 0 0 GCGGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGAAGCAACGGTTCCGACTACTCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:2T45C21 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_451_968_3:0:0_1:0:0_43/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 899 42 70M * 0 0 TGGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGGTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38T31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_492_969_1:0:0_0:0:0_37e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 900 42 70M * 0 0 GGTTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_507_970_1:0:0_3:0:0_145/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 901 40 70M * 0 0 GGTTCACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGAAACGCTTCCGACTACTCCGCTGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T44C4G18 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_460_973_3:0:0_2:0:0_3cc/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 904 42 70M * 0 0 TCACTGCCCGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCGGCGGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G55T5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_468_974_4:0:0_3:0:0_8c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 905 40 70M * 0 0 CACTGCCGGTAATGAAAATGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCAGACTACTCCGCTGAGGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:18A32C13C4 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_518_974_1:0:0_2:0:0_1a6/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 905 42 70M * 0 0 CACGGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGGGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T25T40 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_504_974_0:0:0_1:0:0_235/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 905 42 70M * 0 0 CACTGCCGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCGGCGGTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:63T6 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_496_976_0:0:0_3:0:0_396/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 907 40 70M * 0 0 CTGCAGGTAATCAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTCCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:4C6G55G2 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_465_977_3:0:0_2:0:0_11b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 908 42 70M * 0 0 TGCCGGTATTGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTAATCCGCTGCGGTGCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8A45C15 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_491_980_0:0:0_2:0:0_2f3/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 911 42 70M * 0 0 CGGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGCTGCGGGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:61G3T4 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_532_981_1:0:0_0:0:0_1c4/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 912 42 70M * 0 0 GGTAATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_471_982_1:0:0_3:0:0_1ef/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 913 40 70M * 0 0 GTAATCAAATAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGAGGTGCTGGCGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:5G3A47C12 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_423_982_0:0:0_1:0:0_37d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 913 42 70M * 0 0 GTAATGATAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:7A62 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_418_984_1:0:0_0:0:0_337/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 915 42 70M * 0 0 AATGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_457_985_0:0:0_2:0:0_372/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 916 42 70M * 0 0 ATGAAAAAGGCGACCTGGTGGTGCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:13G8T47 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_422_985_1:0:0_3:0:0_377/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 916 40 70M * 0 0 AGGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCGGGGACGCAACGGTTCCGTCTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:1T22T17A27 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_515_986_2:0:0_1:0:0_10b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 917 42 70M * 0 0 TGAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCCCTGCGGTGCTGGCGGCCTGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:49G20 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_482_987_2:0:0_3:0:0_5b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 918 40 70M * 0 0 GAAAAAGGCGAGCTGCTGGTTCTGGGACGCTACGGTTCCGACTACTACGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:15G14A15C23 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_538_987_0:0:0_0:0:0_233/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 918 42 70M * 0 0 GAAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_419_987_1:0:0_2:0:0_2a1/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 918 42 70M * 0 0 GTAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGACTGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:1A62C5 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_579_987_1:0:0_3:0:0_3de/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 918 40 70M * 0 0 GAAAAACGCGAGCTGGTGGTGCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGATGGCGGCCTGTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:6G13T36C12 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_463_988_1:0:0_0:0:0_27/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 919 42 70M * 0 0 AAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_531_988_1:0:0_1:0:0_1e2/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 919 42 70M * 0 0 AAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCATCGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:30A39 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_465_988_2:0:0_0:0:0_20b/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 919 42 70M * 0 0 AAAAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_469_990_1:0:0_0:0:0_307/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 921 42 70M * 0 0 AAAGGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_510_992_3:0:0_2:0:0_13/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 923 42 70M * 0 0 AGGAGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGGTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3C26T39 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_507_993_3:0:0_2:0:0_c7/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 924 42 70M * 0 0 CGCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCAGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:0G40C28 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_531_994_1:0:0_1:0:0_21c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 925 42 70M * 0 0 GCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCTACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGCGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:23A46 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_553_994_3:0:0_0:0:0_32d/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 925 42 70M * 0 0 GCGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGCGC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_593_995_3:0:0_1:0:0_ff/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 926 42 70M * 0 0 CGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTACGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGCGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:38C31 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_524_995_0:0:0_0:0:0_323/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 926 42 70M * 0 0 CGAGCTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGCGCC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_552_996_4:0:0_2:0:0_301/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 927 42 70M * 0 0 GAGCTGGTCGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGGTTACGCGCCG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:8G50T10 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_390_997_2:0:0_1:0:0_183/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 928 42 70M * 0 0 AGATGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGCGCCGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:2C67 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_475_997_1:0:0_2:0:0_30c/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 928 42 70M * 0 0 AGCGGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTCCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGCGCCGA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:3T37G28 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_500_999_4:0:0_3:0:0_2ae/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 930 40 70M * 0 0 ATGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCGGTTTAAGCGCCGATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:0C53T5C9 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_566_999_1:0:0_1:0:0_2bb/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 930 42 70M * 0 0 CTGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTGCCGACTACTCCGCTGCGGTGCTGGCGGCCTGTTTACGCGCCGATT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:24T45 YT:Z:UU +gi|110640213|ref|NC_008253.1|_388_1000_1:0:0_1:0:0_16e/1 16 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 931 42 70M * 0 0 TGGTGGTTCTGGGACGCAACGGTTCCGACTACTCCGCTGCGGTCCTGGCGGCCTGTTTACGCGCCGATTG 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:43G26 YT:Z:UU + diff --git a/tests/test_mindepth.py b/tests/test_mindepth.py new file mode 100644 index 0000000..66cc251 --- /dev/null +++ b/tests/test_mindepth.py @@ -0,0 +1,161 @@ +from __future__ import print_function +import unittest +import sys +from compat import ( + unittest, + mock + ) +#sys.path.append('/Users/wovenhead/clones/ngs_mapper/ngs_mapper/') +import numpy as np +import subsample_mindepth as sub +from subsample_mindepth import Alignment, DepthMatrix +from numpy.ma.testutils import assert_equal +from argparse import Namespace + +from past.builtins import map, xrange, filter +#from six import StringIO +#try: +# from StringIO import StringIO +#except ImportError: +# from io import StringIO +# +from io import BytesIO +import os.path + + +THISD = os.path.dirname(os.path.abspath(__file__)) + +def mock_args(wrapper=False): + bamfile = os.path.join(THISD, 'ecoli.bam') + return Namespace(reflength=1000, subsample=40, count_orphans=True, bamfile=bamfile, refseq="gi|110640213|ref|NC_008253.1|") + + +def mock_get_raw_reads( bamfile, regionstr=''): + return ''' gi|110640213|ref|NC_008253.1|_2_451_1:0:0_1:0:0_12b/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 0 42 70M * 0 0 GCT 222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:45A24 YT:Z:UU +10640213|ref|NC_008253.1|_4_510_1:0:0_2:0:0_114/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 0 42 70M * 0 0 TTT 222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:26A43 YT:Z:UU +10640213|ref|NC_008253.1|_5_452_2:0:0_1:0:0_1d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 0 42 70M * 0 0 TT 22 AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:2 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:2 MD:Z:31C23C14 YT:Z:UU +10640213|ref|NC_008253.1|_6_397_0:0:0_0:0:0_2c1/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 0 42 70M * 0 0 TTTC 222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +10640213|ref|NC_008253.1|_7_500_3:0:0_1:0:0_250/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 1 40 70M * 0 0 TCATTC 222222 AS:i:-9 XN:i:0 XM:i:3 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:3 MD:Z:9C27A5A26 YT:Z:UU +10640213|ref|NC_008253.1|_9_557_0:0:0_2:0:0_13d/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 1 42 70M * 0 0 AT 222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU +10640213|ref|NC_008253.1|_10_554_1:0:0_1:0:0_2a/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 2 42 70M * 0 0 TTCTGA 222222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:15G54 YT:Z:UU +10640213|ref|NC_008253.1|_11_515_1:0:0_1:0:0_335/1 0 gi|110640213|ref|NC_008253.1| 2 42 70M * 0 0 TCT 222 AS:i:-3 XN:i:0 XM:i:1 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:1 MD:Z:10A59 YT:Z:UU'''.split('\n') + +def short_mock_get_raw_reads( a, b): + "X 0 X 1 42 70M * 0 0 ATT 222 AS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:70 YT:Z:UU" + +def short_mock_get_alignments( a, b): + return [Alignment('', '', 0, 'A'*1, 0x2), + Alignment('', '', 0, 'A'*2, 0x2), + Alignment('', '', 0, 'A'*3, 0x2)] + + +class SimpleTest(unittest.TestCase): + + #@mock.patch("subsample_mindepth.get_raw_reads", side_effect=short_mock_get_raw_reads) + @mock.patch("subsample_mindepth.get_alignments", side_effect=short_mock_get_alignments) + def setUp(self, get_raw_reads_function): + #self.raw_reads = self.mock_get_raw_reads("", "") + self.reads = short_mock_get_alignments('', '') + self.raw_reads = mock_get_raw_reads('', '') + self.matrix = DepthMatrix(3, allow_orphans=True) + self.matrix.make_seq_matrix("", "") + + @mock.patch("subsample_mindepth.get_raw_reads", side_effect=mock_get_raw_reads) + def complexSetUp(self, func): + self.matrix.make_seq_matrix('', '') + pass + + + + def test_simple_get_depths(self): + expected_depths = np.array([3, 2, 1]) + result = self.matrix.get_depths(self.reads) + #print(result) + assert_equal(expected_depths, result) + + def test_get_candidate_sequences(self): + # use the reads from setup and at position 0 + expected = self.reads + result = self.matrix.get_candidate_sequences(0) + self.assertEquals(expected, result) + + def test_get_candidate_sequences_no_candidates(self): + result = self.matrix.get_candidate_sequences(5) + self.assertEquals([], result) + + + def test_yield_greatest_overlaps(self): + expected = [Alignment('', '', 0, 'A'*1, 0x2)] + + + def test_parse_alignment(self): + expected = Alignment(self.raw_reads[0], "gi|110640213|ref|NC_008253.1|_2_451_1:0:0_1:0:0_12b/1", 0, "GCT", 0) + result = sub.parse_alignment(self.raw_reads[0]) + self.assertEquals(expected, result) + + @mock.patch("subsample_mindepth.get_raw_reads", side_effect=mock_get_raw_reads) + def test_make_seq_matrix(self, get_reads_function): + expected_lengths = [4, 2, 2] + self.matrix.make_seq_matrix("mockecoli.sam", "gi|110640213|ref|NC_008253.1|") + actual_lengths = map(len, self.matrix.seq_matrix) + self.assertEquals(expected_lengths, actual_lengths) + + def test_get_raw_reads(self): + pass + + def test_yield_greatest_overlaps_ecoli(self): + self.complexSetUp() + expected = [sub.parse_alignment(self.raw_reads[-2]), sub.parse_alignment(self.raw_reads[4])] + for seq in expected: + seq.pick() + result = list(self.matrix.yield_greatest_overlaps(3, 2)) + self.assertEquals(expected, result) + #expected = self.matrix.seq_matrix[2][0] + pass + + def test_pickreads(self): + pass + + def test_minimize_depths_ecoli(self): + self.complexSetUp() + seqs = map(sub.parse_alignment, self.raw_reads) + expected_matrix = [ + [seqs[0], seqs[1], seqs[3]], + [seqs[4]], + [seqs[6], seqs[7]] + ] + expected_list = [ seqs[0], seqs[1], seqs[3], seqs[4], seqs[6], seqs[7] ] + for seq in expected_list: + seq.pick() + expected_depths = np.array([3, 4, 6, 4, 3, 2, 2, 1]) + self.matrix.min_depth = 3 + self.matrix.minimize_depths() + actual_matrix = self.matrix.seq_matrix + for row in actual_matrix: + for seq in row: + if not seq.picked: + row.remove(seq) + + self.assertEquals(expected_matrix, actual_matrix) + assert_equal(expected_depths, self.matrix.depth_array) + self.assertEquals([seq.string for seq in expected_list], sub.flatten_and_filter_matrix(self.matrix.seq_matrix)) + + + + + @mock.patch("subsamplebam.parse_args", side_effect=mock_args) + @mock.patch('subsamplebam.sys.stdout', new_callable=BytesIO) + def test_main(self, mock_stdout, func): + sub.main() + + samfile = os.path.join(THISD, 'test40.sam') + expected = open(samfile, 'r').read().strip() + result = str(mock_stdout.getvalue().strip().decode('UTF-8')); + self.assertEquals(expected, result) + + + + + + + diff --git a/tests/test_subsamplebam.py b/tests/test_subsamplebam.py index 02127aa..4696fe1 100644 --- a/tests/test_subsamplebam.py +++ b/tests/test_subsamplebam.py @@ -132,15 +132,6 @@ def setUp(self): ) ] - @mock.patch('subsamplebam.SeqIO.parse') - def test_returns_dictionary_by_id_values_are_lengths(self, m_seqio_parse): - m_seqio_parse.return_value = self.mock_seqrecords - r = subsamplebam.reference_info('reference.fasta') - for rec in self.mock_seqrecords: - seqlen = len(rec.seq) - self.assertEqual(seqlen, r[rec.id]) - -@mock.patch('subsamplebam.SeqIO.parse') @mock.patch('subsamplebam.multiprocessing.Pool') @mock.patch('subsamplebam.subprocess.Popen') class TestRandomlySelectsReads(unittest.TestCase): @@ -158,7 +149,7 @@ def setUp(self): 'read10 1 chr1 1 60 10M = 1 1 TTTCGAATC FFFFFFFFF NM:i:3 AS:i:231 XS:i:0 RG:Z:MiSeq', ) - def test_randomly_selects_correct_amount_of_items(self, mpopen, mpool, mparse): + def test_randomly_selects_correct_amount_of_items(self, mpopen, mpool): mpopen.return_value.poll.return_value = None mpopen.return_value.stdout.__iter__.return_value = self.samview_lines[1:] mpopen.return_value.stdout.readline.return_value = self.samview_lines[0] @@ -171,7 +162,7 @@ def test_randomly_selects_correct_amount_of_items(self, mpopen, mpool, mparse): self.assertEqual(set(self.samview_lines), r) - def test_handles_missing_depth_error(self, mpopen, mpool, mparse): + def test_handles_missing_depth_error(self, mpopen, mpool): mpopen.return_value.poll.return_value = None mpopen.return_value.stdout.__iter__.return_value = self.samview_lines[1:] mpopen.return_value.stdout.readline.return_value = self.samview_lines[0] diff --git a/tox.ini b/tox.ini index b15cdf8..c1efbdd 100644 --- a/tox.ini +++ b/tox.ini @@ -5,4 +5,7 @@ deps = -rtests/requirements-dev.txt -rrequirements.txt py26: unittest2 -commands = nosetests --with-coverage --cover-package subsamplebam --cover-branches --cover-html +commands = {toxinidir}/tests/install_samtools.sh + nosetests --with-coverage --cover-package subsamplebam --cover-branches --cover-html +setenv = + PATH={env:PATH}:{toxinidir}/bin