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易宏基因组(EasyMetagenome)——最简单易学易用的宏基因组分析流程

版本：EasyMetagenome v1.09

更新时间：2020/10/26

文件介绍

• 1soft_db.sh：软件和数据库安装
• 2pipeline.sh：分析流程
• 3FAQ.sh：常见问题

使用方法

在64位版本系统，如Ubuntu 18.04/20.04，CentOS7/8的系统

在命令行，或RStudio的Shell环境下使用，可以有道云笔记中显示代码目录，方便预览大纲

引用

使用此流程代码，请引用

Yong-Xin Liu, Yuan Qin, Tong Chen, Meiping Lu, Xubo Qian, Xiaoxuan Guo & Yang Bai. (2020). A practical guide to amplicon and metagenomic analysis of microbiome data. Protein & Cell 11, doi: https://doi.org/10.1007/s13238-020-00724-8