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"HG03797", "HG03798", "HG03799", "HG03800", "HG03801", "HG03802", "HG03803", "HG03804", "HG03805", "HG03806", "HG03807", "HG03808", "HG03809", "HG03811", "HG03812", "HG03813", "HG03814", "HG03815", "HG03816", "HG03817", "HG03821", "HG03822", "HG03823", "HG03824", "HG03825", "HG03826", "HG03829", "HG03830", "HG03831", "HG03832", "HG03833", "HG03834", "HG03835", "HG03836", "HG03837", "HG03838", "HG03840", "HG03842", "HG03844", "HG03845", "HG03846", "HG03847", "HG03848", "HG03849", "HG03850", "HG03851", "HG03854", "HG03856", "HG03857", "HG03858", "HG03861", "HG03862", "HG03863", "HG03864", "HG03866", "HG03867", "HG03868", "HG03869", "HG03870", "HG03871", "HG03872", "HG03873", "HG03874", "HG03875", "HG03876", "HG03879", "HG03882", "HG03884", "HG03885", "HG03886", "HG03887", "HG03888", "HG03890", "HG03894", "HG03895", "HG03896", "HG03897", "HG03898", "HG03899", "HG03900", "HG03901", "HG03902", "HG03903", "HG03904", "HG03905", "HG03906", "HG03907", "HG03908", "HG03909", "HG03910", "HG03911", 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"HG04063", "HG04067", "HG04070", "HG04075", "HG04076", "HG04080", "HG04090", "HG04093", "HG04094", "HG04096", "HG04098", "HG04099", "HG04100", "HG04106", "HG04107", "HG04114", "HG04115", "HG04118", "HG04122", "HG04127", "HG04128", "HG04131", "HG04132", "HG04133", "HG04134", "HG04135", "HG04136", "HG04140", "HG04141", "HG04142", "HG04144", "HG04146", "HG04147", "HG04148", "HG04149", "HG04150", "HG04151", "HG04152", "HG04153", "HG04155", "HG04156", "HG04157", "HG04158", "HG04159", "HG04160", "HG04161", "HG04162", "HG04164", "HG04171", "HG04173", "HG04174", "HG04175", "HG04176", "HG04177", "HG04180", "HG04181", "HG04182", "HG04183", "HG04184", "HG04185", "HG04186", "HG04187", "HG04188", "HG04189", "HG04191", "HG04192", "HG04193", "HG04194", "HG04195", "HG04197", "HG04198", "HG04199", "HG04200", "HG04202", "HG04204", "HG04206", "HG04208", "HG04209", "HG04210", "HG04211", "HG04212", "HG04214", "HG04215", "HG04216", "HG04217", "HG04219", "HG04222", "HG04225", "HG04227", "HG04228", "HG04229", "HG04235", "HG04238", "HG04239", "NA20845", "NA20846", "NA20847", "NA20849", "NA20850", "NA20851", "NA20852", "NA20853", "NA20854", "NA20856", "NA20858", "NA20859", "NA20861", "NA20862", "NA20863", "NA20864", "NA20866", "NA20867", "NA20868", "NA20869", "NA20870", "NA20871", "NA20872", "NA20873", "NA20874", "NA20875", "NA20876", "NA20877", "NA20878", "NA20879", "NA20881", "NA20882", "NA20883", "NA20884", "NA20885", "NA20886", "NA20887", "NA20888", "NA20889", "NA20890", "NA20891", "NA20892", "NA20893", "NA20894", "NA20895", "NA20896", "NA20897", "NA20898", "NA20899", "NA20900", "NA20901", "NA20902", "NA20903", "NA20904", "NA20905", "NA20906", "NA20907", "NA20908", "NA20909", "NA20910", "NA20911", "NA21086", "NA21087", "NA21088", "NA21089", "NA21090", "NA21091", "NA21092", "NA21093", "NA21094", "NA21095", "NA21097", "NA21098", "NA21099", "NA21100", "NA21101", "NA21102", "NA21103", "NA21104", "NA21105", "NA21106", "NA21107", "NA21108", "NA21109", "NA21110", "NA21111", "NA21112", "NA21113", 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var radius = 400;
var cluster = d3.layout.cluster()
.size([360, radius - 50]);
// define div for tooltip
var div = d3.select("body").append("div")
.attr("class", "tooltip")
.style("opacity", 0);
var diagonal = d3.svg.diagonal.radial()
.projection(function (d) {
return [d.y, d.x / 180 * Math.PI];
});
var svg = d3.select("body").append("svg")
.attr("width", radius * 3)
.attr("height", radius * 2)
.append("g")
.attr("transform", "translate(" + radius * 1.5 + "," + radius + ")");
var job_id = '<?php echo $_GET["job_id"] ?>';
var json_path = "./record/".concat(job_id).concat("/clustering.json");
d3.json(json_path, function (error, root) {
if (error) throw error;
var nodes = cluster.nodes(root);
var link = svg.selectAll("path.link")
.data(cluster.links(nodes))
.enter().append("path")
.attr("class", "link")
.attr("d", diagonal);
var node = svg.selectAll("g.node")
.data(nodes)
.enter().append("g")
.attr("class", "node")
.attr("transform", function (d) {
return "rotate(" + (d.x - 90) + ")translate(" + d.y + ")";
});
node.append("ellipse")
.attr("rx", function (d) {
if (d.name == '') {
return 0
} else {
return 20.0
}
})
.attr("ry", function (d) {
if (d.name == '') {
return 0
} else {
return 0.2
}
})
.style("fill", function (d) {
if (afr.indexOf(d.name) != -1) {
return '#D7F9F1'
}
else if (amr.indexOf(d.name) != -1) {
return '#7AA095'
}
else if (eur.indexOf(d.name) != -1) {
return '#40531B'
}
else if (eas.indexOf(d.name) != -1) {
return '#618B4A'
}
else if (sas.indexOf(d.name) != -1) {
return '#AFBC88'
}
else {
return '#CCCCCC'
}
})
.style("stroke", function (d) {
if (afr.indexOf(d.name) != -1) {
return '#D7F9F1'
}
else if (amr.indexOf(d.name) != -1) {
return '#7AA095'
}
else if (eur.indexOf(d.name) != -1) {
return '#40531B'
}
else if (eas.indexOf(d.name) != -1) {
return '#618B4A'
}
else if (sas.indexOf(d.name) != -1) {
return '#AFBC88'
}
else {
return '#CCCCCC'
}
})
.on("mouseover", function (d) {
div.transition()
.duration(2)
.style("opacity", .9);
div.html(d.name + "<br/>" + d.popcode)
.style("left", (d3.event.pageX) + "px")
.style("top", (d3.event.pageY - 28) + "px");
})
.on("mouseout", function (d) {
div.transition()
.duration(500)
.style("opacity", 0);
});
node.append("text").attr("dy", ".31em")
.attr("text-anchor", function (d) {
return d.x < 180 ? "start" : "end";
})
.attr("transform", function (d) {
return d.x < 180 ? "translate(8)" : "rotate(180)translate(-8)";
})
;
});
d3.select(self.frameElement).style("height", radius * 2 + "px");
</script>
</div><!--/.end of draw d3.js-->
<!-- Get Mysql Connection -->
<?php
$link = mysql_connect("localhost", "callsobing", "wannatobetop") or
die("
<div class=\"alert bg-danger\" role=\"alert\"><svg class=\"glyph stroked cancel\">
<use xlink:href=\"#stroked-cancel\"></use></svg>Oooops, Something went wrong. Seems like we have problem connecting to our database..</div><img src=\"img/sorry.jpg\">
<meta http-equiv=\"refresh\" content=\"5;url=submit.html\">
");
mysql_select_db("varclust", $link) or
die("
<div class=\"alert bg-danger\" role=\"alert\"><svg class=\"glyph stroked cancel\">
<use xlink:href=\"#stroked-cancel\"></use></svg>Oooops, Something went wrong. Seems like we cannot update our database....</div><img src=\"img/sorry.jpg\">
<meta http-equiv=\"refresh\" content=\"5;url=submit.html\">
");
$job_id = $_GET["job_id"];
$sql = "SELECT * FROM `jobs` WHERE `job_id`='$job_id'";
$result = mysql_query($sql, $link) or
die ("
<div class=\"alert bg-danger\" role=\"alert\"><svg class=\"glyph stroked cancel\">
<use xlink:href=\"#stroked-cancel\"></use></svg>Oooops, Something went wrong. Seems like we are facing some technical issues during selecting new records in the database....</div><img src=\"img/sorry.jpg\">
<meta http-equiv=\"refresh\" content=\"5;url=submit.html\">
");
$nums = mysql_num_rows($result);
if(isset($_GET["job_id"])){
if($nums == 0){
die("
<div class=\"alert bg-danger\" role=\"alert\"><svg class=\"glyph stroked cancel\">
<use xlink:href=\"#stroked-cancel\"></use></svg>Oooops, the Job ID you provided is not exist in our database!</div><img src=\"img/sorry.jpg\">
<meta http-equiv=\"refresh\" content=\"5;url=result.php\">
");
}
}
$sqlarray = array();
// Mysql for query and display purpose
$link_for_query = mysqli_connect("localhost", "callsobing", "wannatobetop", "varclust") or
die("
<div class=\"alert bg-danger\" role=\"alert\"><svg class=\"glyph stroked cancel\">
<use xlink:href=\"#stroked-cancel\"></use></svg>Oooops, Something went wrong. Seems like we have problem connecting to our database..</div><img src=\"img/sorry.jpg\">
<meta http-equiv=\"refresh\" content=\"5;url=submit.html\">
");
$result_for_query = mysqli_query($link_for_query, $sql) or
die ("
<div class=\"alert bg-danger\" role=\"alert\"><svg class=\"glyph stroked cancel\">
<use xlink:href=\"#stroked-cancel\"></use></svg>Oooops, Something went wrong. Seems like we are facing some technical issues during selecting new records in the database....</div><img src=\"img/sorry.jpg\">
<meta http-equiv=\"refresh\" content=\"5;url=submit.html\">
");
?>
<div class="col-lg-12">
<label>Job Details</label>
<table>
<?php
while($row = mysqli_fetch_assoc($result_for_query))
{
?>
<tr>
<td>E-mail</td>
<td><?php echo $row['user_token'] ?></td>
</tr>
<tr>
<td>Job ID</td>
<td><?php echo $row['job_id'] ?></td>
</tr>
<tr>
<td>Chromosome</td>
<td>chr<?php echo $row['chromosome'] ?></td>
</tr>
<tr>
<td>Start</td>
<td><?php echo $row['start'] ?></td>
</tr>
<tr>
<td>End</td>
<td><?php echo $row['end'] ?></td>
</tr>
<tr>
<td>Clustering Method</td>
<td><?php echo $row['clustering_m'] ?></td>
</tr>
<tr>
<td>Notes</td>
<td><?php echo $row['note'] ?></td>
</tr>
<?php
}
?>
</table>
</div>
</div> <!--/.main-->
<div class="col-sm-9 col-sm-offset-3 col-lg-10 col-lg-offset-2 main">
<?php
if(isset($_GET["job_id"])){
$myfile = fopen("./record/".$_GET["job_id"]."/entropy", "r");
$afr = fgets($myfile);
$amr = fgets($myfile);
$eur = fgets($myfile);
$eas = fgets($myfile);
$sas = fgets($myfile);
$all = fgets($myfile);
echo '
<div class="row">
<div class="col-xs-6 col-md-4">
<div class="panel panel-default">
<div class="panel-body easypiechart-panel">
<h4>Total Score:</h4>
<div class="easypiechart" id="easypiechart-blue" data-percent="'.$all.'" ><span class="percent">'.$all.'%</span>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="col-xs-6 col-md-4">
<div class="panel panel-default">
<div class="panel-body easypiechart-panel">
<h4>EAS score:</h4>
<div class="easypiechart" id="easypiechart-yellow" data-percent="'.$eas.'" ><span class="percent">'.$eas.'%</span>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="col-xs-6 col-md-4">
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<h4>EUR score:</h4>
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<h4>AMR score:</h4>
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<h4>AFR score:</h4>
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