What does this repository contains:
├── Dockerfile
├── LICENSE
├── README.dev.md
├── README.md
├── data_test
│ ├── h5ad_test
│ │ └── pbmc3k.h5ad
│ ├── h5seurat
│ │ └── pbmc.H5Seurat
│ ├── rds
│ │ └── pbmc3k_final.rds
│ └── sce_test
│ └── sce.rds
├── docs
│ ├── AddFolderFromCourse.gif
│ ├── AdvSingleCell_OpenNotebooks.gif
│ ├── BulkRNA_OpenNotebooks.gif
│ ├── README.md
│ ├── RNAseqCLI_startCLI.gif
│ ├── RNAseqCLI_startNotebook.gif
│ └── transcriptomics_logo.png
├── pbmc3k
│ ├── markers.json
│ └── pbmc3k.h5ad
├── renv.dec2024.lock
├── renv.lock
└── scripts
├── Rinstallations.R
├── doubletfinder.zip
├── environment.yml
├── external_packages_for_conda.R
├── ggforestplot.zip
├── hdWGCNA-69110d0.zip
├── install_renv.R
├── mergeRenv.R
├── set_Rprofile.R
├── start-app
└── welcome_message.md