sample_input.bed

chr5	1295227	1295228	G	A
chr5	1295227	1295228	G	T
chr5	1295249	1295250	G	A
chr17	47755597	47755598	C	T
chr17	47755687	47755688	G	A
chr17	47690730	47690731	G	T
chr17	47712741	47712742	G	T
chr17	47682584	47682585	C	A
chr17	47721591	47721592	G	A
chr17	47738369	47738370	A	G
chr17	47690730	47690731	G	T
chr12	25378561	25378562	C	T
chr12	25365578	25365579	C	A
chr12	25398283	25398284	C	A
chr17	7577057	7577058	C	A
chr17	7578474	7578475	G	A
chr17	7577559	7577560	A	G
chr17	7577579	7577580	T	C
chr17	7578554	7578555	C	T
chr17	7577546	7577547	C	T
chr17	7579357	7579358	C	A
chr17	7575266	7575267	T	G
chr17	7577093	7577094	G	A
chr17	7577537	7577538	C	T
chr17	7578549	7578550	G	T
chr17	7578234	7578235	T	C
chr1	213941196	213941197	G	T
chr1	36205041	36205042	C	A
chr1	100013396	100013397	C	A
chr1	100088462	100088463	C	T
chr2	100013108	100013109	C	T
chr3	100017919	100017920	G	A
chr21	10086155	10086156	A	C
chr11	100006481	100006482	C	T
chr1	569003	569004	T	C
chr1	152304995	152304996	A	G