diff --git a/cran-comments.md b/cran-comments.md index d84d2480..c31e699a 100644 --- a/cran-comments.md +++ b/cran-comments.md @@ -13,24 +13,27 @@ cf. https://github.com/larmarange/broom.helpers/actions/workflows/R-CMD-check.ya ## revdepcheck results -We checked 13 reverse dependencies (12 from CRAN + 1 from Bioconductor), comparing R CMD check results across CRAN and dev versions of this package. +We checked 14 reverse dependencies (13 from CRAN + 1 from Bioconductor), comparing R CMD check results across CRAN and dev versions of this package. * We saw 0 new problems - * We failed to check 1 packages + * We failed to check 4 packages Issues with CRAN packages are summarised below. ### Failed to check +* cardx (NA) * gtsummary (NA) +* mmrm (NA) +* smdi (NA) ## recheck GitHub action ------- Check results summary ------ Check status summary: - OK - Source packages 1 - Reverse depends 13 + NOTE OK + Source packages 0 1 + Reverse depends 1 13 Check results summary: broom.helpers ... OK @@ -42,6 +45,8 @@ rdepends_gtreg ... OK rdepends_gtsummary ... OK rdepends_iNZightRegression ... OK rdepends_logitr ... OK +rdepends_mmrm ... NOTE +* checking installed package size ... NOTE rdepends_pubh ... OK rdepends_regport ... OK rdepends_simstudy ... OK diff --git a/revdep/README.md b/revdep/README.md index 161da63b..f8982969 100644 --- a/revdep/README.md +++ b/revdep/README.md @@ -1,68 +1,71 @@ # Platform -|field |value | -|:--------|:------------------------------------------------| -|version |R version 4.4.1 (2024-06-14 ucrt) | -|os |Windows 11 x64 (build 22631) | -|system |x86_64, mingw32 | -|ui |RStudio | -|language |(EN) | -|collate |French_France.utf8 | -|ctype |French_France.utf8 | -|tz |Europe/Paris | -|date |2024-08-28 | -|rstudio |2023.12.1+402 Ocean Storm (desktop) | -|pandoc |3.1.11 @ C:\PROGRA~1\Quarto\bin\tools\pandoc.exe | +|field |value | +|:--------|:-------------------------------------| +|version |R version 4.4.1 (2024-06-14 ucrt) | +|os |Windows 11 x64 (build 26100) | +|system |x86_64, mingw32 | +|ui |RStudio | +|language |(EN) | +|collate |French_France.utf8 | +|ctype |French_France.utf8 | +|tz |Europe/Paris | +|date |2025-01-02 | +|rstudio |2024.12.0+467 Kousa Dogwood (desktop) | +|pandoc |NA | # Dependencies -|package |old |new |Δ | -|:-------------|:------|:-----------|:--| -|broom.helpers |1.16.0 |1.16.0.9000 |* | -|backports |1.5.0 |1.5.0 | | -|bit |4.0.5 |4.0.5 | | -|bit64 |4.0.5 |4.0.5 | | -|broom |1.0.6 |1.0.6 | | -|cards |NA |0.2.1 |* | -|cli |3.6.3 |3.6.3 | | -|clipr |0.8.0 |0.8.0 | | -|cpp11 |0.5.0 |0.5.0 | | -|crayon |1.5.3 |1.5.3 | | -|dplyr |1.1.4 |1.1.4 | | -|fansi |1.0.6 |1.0.6 | | -|forcats |1.0.0 |1.0.0 | | -|generics |0.1.3 |0.1.3 | | -|glue |1.7.0 |1.7.0 | | -|haven |2.5.4 |2.5.4 | | -|hms |1.1.3 |1.1.3 | | -|labelled |2.13.0 |2.13.0 | | -|lifecycle |1.0.4 |1.0.4 | | -|magrittr |2.0.3 |2.0.3 | | -|pillar |1.9.0 |1.9.0 | | -|pkgconfig |2.0.3 |2.0.3 | | -|prettyunits |1.2.0 |1.2.0 | | -|progress |1.2.3 |1.2.3 | | -|purrr |1.0.2 |1.0.2 | | -|R6 |2.5.1 |2.5.1 | | -|readr |2.1.5 |2.1.5 | | -|rlang |1.1.4 |1.1.4 | | -|stringi |1.8.4 |1.8.4 | | -|stringr |1.5.1 |1.5.1 | | -|tibble |3.2.1 |3.2.1 | | -|tidyr |1.3.1 |1.3.1 | | -|tidyselect |1.2.1 |1.2.1 | | -|tzdb |0.4.0 |0.4.0 | | -|utf8 |1.2.4 |1.2.4 | | -|vctrs |0.6.5 |0.6.5 | | -|vroom |1.6.5 |1.6.5 | | -|withr |3.0.1 |3.0.1 | | +|package |old |new |Δ | +|:-------------|:-------|:-----------|:--| +|broom.helpers |1.17.0 |1.17.0.9000 |* | +|backports |1.5.0 |1.5.0 | | +|bit |4.5.0.1 |4.5.0.1 | | +|bit64 |4.5.2 |4.5.2 | | +|broom |1.0.7 |1.0.7 | | +|cards |0.4.0 |0.4.0 | | +|cli |3.6.3 |3.6.3 | | +|clipr |0.8.0 |0.8.0 | | +|cpp11 |0.5.1 |0.5.1 | | +|crayon |1.5.3 |1.5.3 | | +|dplyr |1.1.4 |1.1.4 | | +|fansi |1.0.6 |1.0.6 | | +|forcats |1.0.0 |1.0.0 | | +|generics |0.1.3 |0.1.3 | | +|glue |1.8.0 |1.8.0 | | +|haven |2.5.4 |2.5.4 | | +|hms |1.1.3 |1.1.3 | | +|labelled |2.13.0 |2.13.0 | | +|lifecycle |1.0.4 |1.0.4 | | +|magrittr |2.0.3 |2.0.3 | | +|pillar |1.10.0 |1.10.0 | | +|pkgconfig |2.0.3 |2.0.3 | | +|prettyunits |1.2.0 |1.2.0 | | +|progress |1.2.3 |1.2.3 | | +|purrr |1.0.2 |1.0.2 | | +|R6 |2.5.1 |2.5.1 | | +|readr |2.1.5 |2.1.5 | | +|rlang |1.1.4 |1.1.4 | | +|stringi |1.8.4 |1.8.4 | | +|stringr |1.5.1 |1.5.1 | | +|tibble |3.2.1 |3.2.1 | | +|tidyr |1.3.1 |1.3.1 | | +|tidyselect |1.2.1 |1.2.1 | | +|tzdb |0.4.0 |0.4.0 | | +|utf8 |1.2.4 |1.2.4 | | +|vctrs |0.6.5 |0.6.5 | | +|vroom |1.6.5 |1.6.5 | | +|withr |3.0.2 |3.0.2 | | # Revdeps -## Failed to check (2) +## Failed to check (5) |package |version |error |warning |note | |:---------|:-------|:-----|:-------|:----| -|gtsummary |2.0.1 |1 | | | +|cardx |0.2.2 |1 | | | +|gtsummary |2.0.4 |1 | | | +|mmrm |0.3.14 |1 | |1 | |simstudy |? | | | | +|smdi |0.3.1 |2 | | | diff --git a/revdep/cran.md b/revdep/cran.md index 11a996d2..45f9cdfb 100644 --- a/revdep/cran.md +++ b/revdep/cran.md @@ -1,12 +1,15 @@ ## revdepcheck results -We checked 13 reverse dependencies (12 from CRAN + 1 from Bioconductor), comparing R CMD check results across CRAN and dev versions of this package. +We checked 14 reverse dependencies (13 from CRAN + 1 from Bioconductor), comparing R CMD check results across CRAN and dev versions of this package. * We saw 0 new problems - * We failed to check 1 packages + * We failed to check 4 packages Issues with CRAN packages are summarised below. ### Failed to check +* cardx (NA) * gtsummary (NA) +* mmrm (NA) +* smdi (NA) diff --git a/revdep/failures.md b/revdep/failures.md index c3d4bc2a..42bd34ec 100644 --- a/revdep/failures.md +++ b/revdep/failures.md @@ -1,12 +1,31 @@ +# cardx + +
+ +* Version: 0.2.2 +* GitHub: https://github.com/insightsengineering/cardx +* Source code: https://github.com/cran/cardx +* Date/Publication: 2024-11-27 17:20:02 UTC +* Number of recursive dependencies: 125 + +Run `revdepcheck::revdep_details(, "cardx")` for more info + +
+ +## In both + +* R CMD check timed out + + # gtsummary
-* Version: 2.0.1 +* Version: 2.0.4 * GitHub: https://github.com/ddsjoberg/gtsummary * Source code: https://github.com/cran/gtsummary -* Date/Publication: 2024-08-18 00:10:02 UTC -* Number of recursive dependencies: 195 +* Date/Publication: 2024-11-30 18:40:02 UTC +* Number of recursive dependencies: 186 Run `revdepcheck::revdep_details(, "gtsummary")` for more info @@ -17,6 +36,32 @@ Run `revdepcheck::revdep_details(, "gtsummary")` for more info * R CMD check timed out +# mmrm + +
+ +* Version: 0.3.14 +* GitHub: https://github.com/openpharma/mmrm +* Source code: https://github.com/cran/mmrm +* Date/Publication: 2024-09-27 23:30:01 UTC +* Number of recursive dependencies: 176 + +Run `revdepcheck::revdep_details(, "mmrm")` for more info + +
+ +## In both + +* R CMD check timed out + + +* checking installed package size ... NOTE + ``` + installed size is 6.2Mb + sub-directories of 1Mb or more: + libs 4.5Mb + ``` + # simstudy
@@ -33,27 +78,27 @@ Run `revdepcheck::revdep_details(, "gtsummary")` for more info ### Devel ``` + + Des versions binaires sont disponibles mais les versions des sources + sont plus récentes: + binary source needs_compilation +MASS 7.3-61 7.3-63 TRUE +nnet 7.3-19 7.3-20 TRUE + + Binaries will be installed le package 'abind' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés le package 'askpass' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'backports' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'base64enc' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'BH' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bigD' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bigmemory' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bigmemory.sri' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bit' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bit64' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés ... -le package 'viridis' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'viridisLite' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'vroom' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'waldo' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'withr' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'xfun' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'xml2' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'xtable' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'yaml' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'zoo' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'prettyunits' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'processx' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'progress' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'ps' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'purrr' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'quantreg' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'R6' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'rappdirs' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'RColorBrewer' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'Rcpp' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés @@ -63,30 +108,74 @@ le package 'zoo' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées a ### CRAN ``` + + Des versions binaires sont disponibles mais les versions des sources + sont plus récentes: + binary source needs_compilation +MASS 7.3-61 7.3-63 TRUE +nnet 7.3-19 7.3-20 TRUE + + Binaries will be installed le package 'abind' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés le package 'askpass' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'backports' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'base64enc' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'BH' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bigD' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bigmemory' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bigmemory.sri' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bit' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'bit64' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés ... -le package 'viridis' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'viridisLite' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'vroom' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'waldo' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'withr' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'xfun' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'xml2' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'xtable' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'yaml' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés -le package 'zoo' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'prettyunits' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'processx' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'progress' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'ps' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'purrr' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'quantreg' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'R6' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'rappdirs' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'RColorBrewer' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés +le package 'Rcpp' a été décompressé et les sommes MD5 ont été vérifiées avec succés ``` +# smdi + +
+ +* Version: 0.3.1 +* GitHub: NA +* Source code: https://github.com/cran/smdi +* Date/Publication: 2024-10-04 07:10:02 UTC +* Number of recursive dependencies: 217 + +Run `revdepcheck::revdep_details(, "smdi")` for more info + +
+ +## In both + +* checking running R code from vignettes ... + ``` + 'a_data_generation.Rmd' using 'UTF-8'... failed + 'b_routine_diagnostics.Rmd' using 'UTF-8'... failed + 'c_multivariate_missingness.Rmd' using 'UTF-8'... OK + 'd_narfcs_sensitivity_analysis.Rmd' using 'UTF-8'... OK + 'smdi.Rmd' using 'UTF-8'... OK + ERROR + Errors in running code in vignettes: + when running code in 'a_data_generation.Rmd' + ... + redémarrage de l'évaluation d'une promesse interrompue + ... + here() starts at C:/Users/josep/AppData/Local/Temp/Rtmp65DrD4/file7f4421a344be/vignettes + + > library(knitr) + Avis : le package 'knitr' a été compilé avec la version R 4.4.2 + + > include_graphics(here("vignettes", "smdi_diagnose_table.png")) + + When sourcing 'b_routine_diagnostics.R': + Erreur : Cannot find the file(s): "C:/Users/josep/AppData/Local/Temp/Rtmp65DrD4/file7f4421a344be/vignettes/vignettes/smdi_diagnose_table.png" + Exécution arrêtée + ``` + +* R CMD check timed out + +