Hw4 mukhametshina #29
Conversation
|
comment |
There was a problem hiding this comment.
Привет!
Извини пожалуйста что так поздно проверил работу!
В каком то смысле это тоже реальная сторона программирования. Можешь загуглить то сколько мемов есть про approve my pull request, ахах
Общий комментарий:
- В целом хорошая работа, почти везде неплохой код и адекватые идеи функций
- Есть какие-то проблемки с локальным качеством типа неймингов - это все старался отмечать
- Есть небольшая проблема с ошибим дизайном и логикой. Ты добавила одну отдельную ветку с рандомом и input() от пользователя. Я конечно скажу что этого делать было не нужно, но если ты просто хотела попрактиковаться с таким делом - то тогда это все окей и наоборот здорово! Но к сожалению то как это написано получилось немного сумбурно с высоты птичьего полета. То есть у тебя прям везде копипастом повторяется код, функции делают много не своей работы. Это окей, мы только учимся. Но вот важно отметить. У тебя неплохой кодинг, там буквально что-то довести до идеала. Но к этому надо добавить еще умение видеть общую структуру проекта. Было бы здорово нарисовать условно весь пайплайн на бумажке до того как писать код. Хотя если често я так никогда не делаю. Просто когда готовишь еду или ходишь в душ - шепотом про себя говори вслух историю твоего проекта. Историю в смысле что происходит с данными, то есть идею и логику. И тогда поняв что говоришь одно и то же пару раз, поймешь где можно чуть по другому пересобрать. Потому что когда пишешь код прямо пальцами - в этот момент нет времени смотреть на дизайн.
Если кратко, то у тебя подход такой:
Дело_1
Если условие:
Дело_2
Если нет:
Дело_3
Если условие:
Дело_4, return
Если нет:
Дело_5
Если условие:
Дело_6, return
Если нет:
Дело_7, return
В этом плане это кажется вполне straightforward, но чуть более по-программистки было бы собрать в следующем стиле
Если условие:
Сделать такую предобработку
Если условие:
Сделать другую предобработку
Если условие:
Сделать другую предобработку
Дело_1
Дело_2
return
Надеюсь у меня получилось это как то описать. Если что по коду тоже оставил комментарии.
В любом случае, ты молодец! Очень здорово что ты прям попробовала покопаться и поделать разные штуки. Ридми крутой.
Баллы
- README 2.5/2.5
- Операции над белками 6/7.5 (из-за повторений кода и того что я писал выше)
- За проблемы с неймингами и т п -0.1
- За фото команды в README 0.1). Добавил за то что есть, но половину потому что кажется чувак на картинке не принимал участие в этой работе:)
У тебя сдано через полторы недели после дедлайна. Не знаю, у меня хорошее настроение после прочтения этой работы и хочется как то смотивировать тебя присоединятья к нам в поток, поэтому не буду снижать за это баллы. Тем более что сам поздно проверил) Но на будущее не отставай!
Итого: 8.5/10
| @@ -0,0 +1,108 @@ | |||
| [![Будто бы полезная ссылка, но просто попытка вставить ссылку_2]<a href="url"><img src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/66/AminoAcidball_rus.svg/1280px-AminoAcidball_rus.svg.png" align="left" height="128" width="198" ></a>](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BC%D0%B8%D0%BD%D0%BE%D0%BA%D0%B8%D1%81%D0%BB%D0%BE%D1%82%D1%8B) | |||
There was a problem hiding this comment.
Хех, правильно! Потом если когда в жизни будешь вставлять ссылки, сможешь прям отсюда и копировать
| ## Table of contents | ||
|
|
||
| * [Project description](#project-description) | ||
| * [Main part](#Main-part) | ||
| * [Project description](#project-description) | ||
| * [Examples](#examples) | ||
| * [Contact](#contact) | ||
| * [Educational result](#Учебный-результат) | ||
| * [See also](#see-also) |
| ## Project description | ||
| This project was supposed to be carried out in a team, but, unfortunately, I was unable to do only part of this project - all the code and the mini-program were written by me independently. As this HW, I refreshed my memory in working through GitHub, as well as the basic concepts of the Python language. | ||
|
|
||
|  |
| ## Main part | ||
| Implemented the program `amino_acid_tools.py `. This program necessarily contains the `amino_acid_tools` function, as well as other functions that are described below. The `amino_acid_tools` function accepts an arbitrary number of arguments with a sequence of amino acids or several amino acid sequences (*str*), and it is also possible to introduce the word "random", which generates a random chain of amino acids, in addition, you must enter the name of the procedure to be performed (this is always the last argument, *str*, see usage example). After that, the command performs the specified action on all the transmitted sequences. If one sequence is submitted, a string with the result is returned. If several are submitted, a list of strings is returned. | ||
|
|
||
| **Список процедур:** |
| ```shell | ||
| amino_acid_tools('PLfHnfPdD', 'YsGPFEEt', 'ogknHIPTu', 'long_amino_code') | ||
| ``` | ||
| Input: 'PLfHnfPdD', 'YsGPFEEt', 'ogknHIPTu', 'long_amino_code' | ||
| Output: '['ProLeuPheHisAsnPheProAspAsp', 'TyrSerGlyProPheGluGluThr', 'PylGlyLysAsnHisIleProThrSec']' |
There was a problem hiding this comment.
Во, да, так и надо. Чтобы можно было просто скопипастить и прогнать. Только можно наверное вставить оформление не shell, а python. И строчка и Input в целом тут лишняя, у тебя же в коде как раз input и виден:)
| aminoacid_charge = {'R': 1, 'D': -1, 'E': -1, 'K': 1, 'O': 1} | ||
| charge = 0 | ||
| for aminoacid in amino_sequencqe.upper(): | ||
| if aminoacid in 'RDEKO': |
There was a problem hiding this comment.
| if aminoacid in 'RDEKO': | |
| if aminoacid in aa_charges: |
There was a problem hiding this comment.
это будет как раз проверка на наличие в ключах
| if aminoacid in 'RDEKO': | ||
| charge += aminoacid_charge[aminoacid] | ||
| if charge > 0: | ||
| return 'positiv' |
There was a problem hiding this comment.
| return 'positiv' | |
| return 'positive' |
))
А вообще было бы здорово прямо заряд сам и вернуть наверное
| for seq in amino_sequence: | ||
| unique_chars = set(seq) | ||
| amino_acids = set(amino_acid) | ||
| if unique_chars <= amino_acids: | ||
| aminoac_seqs.append(seq) |
There was a problem hiding this comment.
то есть если пользователь добавил что-то неправильное, то он об этом даже и не узнает?
| amino_to_rna (str) or (list): possible RNA sequence | ||
| amino_seq_charge (str) or (list): "positive", "negative" or "neutral" | ||
| """ | ||
| *seqs, function = args |
There was a problem hiding this comment.
Это было актуально в домашке по ДНК/РНК чтобы вы потреннировались с аргументами. Вообще это не очень хорошо, так как по факту сиквенсы и название функции - это разные сущности. А мы их мешаем в одну дырку. Это не хорошо. Есть есть разные штуки - то и принимать их стоит в разные аргументы.
def function(seqs, func):| amino_seq_charge (str) or (list): "positive", "negative" or "neutral" | ||
| """ | ||
| *seqs, function = args | ||
| d_of_functions = {'long_amino_code' : long_amino_code, |
There was a problem hiding this comment.
| d_of_functions = {'long_amino_code' : long_amino_code, | |
| functions = {'long_amino_code' : long_amino_code, |
No description provided.