Update functions florabank #61
Conversation
|
Ik heb even naar de falende test gekeken, en hier is het probleem een generiek probleem omwille van checklist (waar aan gewerkt wordt). Maar ik heb ook even de voorbeelden in de help van de functies getest, en daarvan werken er enkele niet omwille van een error bij de uitvoering van de queries. Kan jij hier even naar kijken? Het gaat over:
Ik ga ook @hansvancalster toevoegen als reviewer. Hij had laatst een opmerking over een van de florabank-functies (een extra veld dat hij graag in de output wou hebben), dus zo kan hij als gebruiker ook feedback geven over wat voor hem belangrijk is. |
|
excuus, er stonden nog wat oude tabel- en kolomnamen in de sql, dat zou nu in orde moeten zijn |
ElsLommelen
force-pushed
the
update-functions-florabank
branch
from
2f23c60 to
e586ace
Compare
There was a problem hiding this comment.
Nadat ik nog enkele niet meer bestaande en niet publiek toegankelijke URLs vervangen heb in het package, slagen de tests ook terug, dus voor mij is het in orde. Bedankt voor je bijdrage, @fredericpiesschaert!
@hansvancalster Heb jij nog opmerkingen? Vermits ik de laatste commit gedaan heb, denk ik dat mijn goedkeuring niet telt en dat jij ook zal moeten goedkeuren vooraleer we kunnen mergen.
|
@ElsLommelen merci om alles na te kijken! Ik kan het blijkbaar zelf wel mergen nu maar misschien toch beter dat @hansvancalster er eerst nog eens een blik op werpt |
R/get_florabank_taxon_ifbl_year.R
Outdated
| "SELECT DISTINCT h.Code AS hok | ||
| , CASE WHEN tmp.code IS NULL THEN h.code ELSE tmp.Code END AS ifbl_4by4 | ||
| , DATEPART(year, e.BeginDatum) AS jaar |
There was a problem hiding this comment.
Om consistent te zijn zou ik hier de naamconventie van de databank overnemen en dus:
- hok -> Hok
- jaar -> Jaar
- ifbl_4by4 -> Ifbl4by4 (?)
There was a problem hiding this comment.
Ik zag ook nog ifbl_number_squares als kolomnaam wanneer ik bv get_florabank_taxon_ifbl_year( con, 1990, "4km-by-4km", "Mossen", collect = TRUE ) opvraag.
Ik heb alle functies getest en alles lijkt prima te werken 👍
There was a problem hiding this comment.
@hansvancalster nog een vraagje over dat laatste. In de beschrijving van de functie staat ook dit: in case the resolution is 4 km x 4 km, the variable ifbl_squares is a concatenation of all nested squares with observations for the taxon in the corresponding year.
Maar dat zit niet in de output van de oude functie, dus ik heb het nu ook niet toegevoegd. Ik kan dat eventueel doen maar ik zie er de meerwaarde niet van in. Gebruiken jullie dat of kan ik dat beter helemaal weglaten?
There was a problem hiding this comment.
Dat mag inderdaad weg. Nooit gebruikt...
There was a problem hiding this comment.
Ziet er goed uit 🥇 Juist nog een kleine opmerking ivm naamconventie (zie aparte comment).
Ik denk dat het ook nuttig zou zijn dat gebruikers in een vignette een paar handige commando's leren kennen voor zeer eenvoudige queries waarvoor we geen functie voorzien. Bv: de tabel met info over IFBL hokken ophalen doe je zo:
library(dplyr)
con <- inbodb::connect_inbo_dbase(database_name = "D0152_00_Flora")
hokinfo <- tbl(con, "Hok") %>% collect()
dbDisconnect(con)
En om te weten welke tabellen in de databank zitten kan je de "connections" viewer pane van RStudio raadplegen.
Zulke kleine tips dus.
Maar dat is geen onderdeel van deze PR.
On 18/02/2025 database D0021_00_userFlora will be archived and replaced with a new production database D0152_00_Flora. In this pull request, the get_florabank functions are updated